広島大学

基本情報

主な職歴

• 2019年07月01日, 2023年03月31日, 広島大学, 大学院統合生命科学研究科, 助教
• 2015年08月01日, 2019年06月30日, 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, ポストドクトラルスカラー
• 2015年04月01日, 2015年07月31日, 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 技術員

学歴

• 広島大学, 大学院理学研究科, 博士課程後期生物科学専攻, 2012年04月, 2015年03月
• 広島大学, 大学院理学研究科, 博士課程前期生物科学専攻, 2010年04月, 2012年03月
• 広島大学, 理学部, 生物科学科, 2006年04月, 2010年03月

学位

• 博士（理学）　(広島大学)
• 修士（理学）　(広島大学)

教育担当

• 【学士課程】 理学部 : 生物科学科 : 生物学プログラム
• 【博士課程前期】 統合生命科学研究科 : 統合生命科学専攻 : 基礎生物学プログラム
• 【博士課程後期】 統合生命科学研究科 : 統合生命科学専攻 : 基礎生物学プログラム

担当主専攻プログラム

• 生物学プログラム

研究分野

• 総合生物 / ゲノム科学 / ゲノム生物学
• 生物学 / 生物科学 / 発生生物学

研究キーワード

• 比較ゲノム, ゲノムアセンブル, 発生, 進化

所属学会

• 日本動物学会
• 日本藻類学会
• 日本植物学会
• 日本水産学会

教育活動

授業担当

1. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, 進化発生学演習
2. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, 卒業研究
3. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, 生物科学基礎実験IV
4. 2024年, 学部専門, セメスター（前期）, 海洋生物学実習Ａ
5. 2024年, 学部専門, セメスター（前期）, 海洋生物学実習Ｂ
6. 2024年, 学部専門, セメスター（前期）, 公開臨海実習
7. 2024年, 学部専門, 通年, 新・海洋生物教育臨海実習
8. 2024年, 学部専門, セメスター（前期）, しまなみ海道域海洋生物学実習
9. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, しまなみ海道域海洋生物学実習

研究活動

学術論文（★は代表的な論文）

1. Ancestral Stem Cell Reprogramming Genes Active in Hemichordate Regeneration, Frontiers in Ecology and Evolution, 10巻, 20220215
   DOIを用いた論文検索結果へのリンク
2. Genome and transcriptome assemblies of the kuruma shrimp, Marsupenaeus japonicus, G3, 2021
   DOIを用いた論文検索結果へのリンク
3. Chloroplast acquisition without the gene transfer in kleptoplastic sea slugs, Plakobranchus ocellatus, eLife, 10巻, pp. e60176, 2021
   DOIを用いた論文検索結果へのリンク
4. Integrated omics unveil the secondary metabolic landscape of a basal dinoflagellate, BMC Biology, 18巻, pp. 139, 2020
   DOIを用いた論文検索結果へのリンク
5. Comparative genomics of four strains of the edible brown alga, Cladosiphon okamuranus, BMC Genomics, 21巻, pp. 422, 2020
   DOIを用いた論文検索結果へのリンク
6. Correlation between organelle genetic variation and RNA editing in dinoflagellates associated with the coral Acropora digitifera, Genome Biology and Evolution, 12巻, 3号, pp. 203-209, 2020
   DOIを用いた論文検索結果へのリンク
7. Organelle inheritance and genome architecture variation in isogamous brown algae, Scientific Reports, 10巻, pp. 2048, 2020
   DOIを用いた論文検索結果へのリンク
8. Differential gene expression in fronds and stolons of the siphonous macroalga, Caulerpa lentillifera, Development, Growth & Differentiation, 61巻, 9号, pp. 475-484, 2019
   DOIを用いた論文検索結果へのリンク
9. Xenacoelomorph-specific Hox peptides: insights into the phylogeny of acoels, nemertodermatids, and xenoturbellids, Zoological Science, 36巻, 5号, pp. 395-401, 2019
   DOIを用いた論文検索結果へのリンク
10. A draft genome assembly of the acoel flatworm Praesagittifera naikaiensis, GigaScience, 8巻, 4号, pp. 1-8, 2019
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
11. A siphonous macroalgal genome suggests convergent functions of homeobox genes in algae and land plants, DNA Research, 26巻, 2号, pp. 183-192, 2019
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
12. Draft genome of the brown alga, Nemacystus decipiens, Onna-1 strain: Fusion of genes involved in the sulfated fucan biosynthesis pathway, Scientific Reports, 9巻, pp. 4607, 2019
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
13. Regeneration in the enteropneust hemichordate, Ptychodera flava, and its evolutionary implications, Development, Growth & Differentiation, 60巻, 6号, pp. 400-408, 2018
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
14. A draft genome of the brown alga, Cladosiphon okamuranus, S-strain: a platform for future studies of 'mozuku' biology, DNA Research, 23巻, 6号, pp. 561-570, 2016
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
15. Hedgehog Expression During Development and Regeneration in the Hemichordate, Ptychodera flava, Zoological Science, 32巻, 1号, pp. 33-37, 2015
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
16. A cDNA resource for gene expression studies of a hemichordate, Ptychodera flava, Zoological Science, 31巻, 7号, pp. 414-420, 2014
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
17. Regeneration in the hemichordate Ptychodera flava, Zoological Science, 27巻, 2号, pp. 91-95, 2010
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
18. 単細胞生物海ぶどうのゲノム研究：単細胞の陸上植物は作れるか, 植物の生長調節, 56巻, 1号, pp. 51-54, 2021
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク

著書等出版物

1. 2022年, Whole-Body Regeneration, Studying Hemichordata WBR Using Ptychodera flava, Humana, 単行本（学術書）, 分担執筆, 978-1-0716-2171-4

招待講演、口頭・ポスター発表等

1. Proteomic analysis of the unicellular macroalga Caulerpa lentillifera, Asuka Arimoto, 24th International Seaweed Symposium 2023, 2023年03月20日, 通常, 英語, ホバート, オーストラリア
2. クルマエビのドラフトゲノム, 第21回マリンバイオテクノロジー学会大会, 2021年05月15日, 通常, 日本語
3. 形態的に異なるオキナワモズク Cladosiphon okamuranus 4株の比較ゲノム解析, 日本藻類学会第45回大会, 2021年03月17日, 通常, 日本語
4. Gene family expansions involving in stress responses in the siphonous macroalga, Caulerpa lentillifera, Asuka Arimoto, Frontiers in Algal Research, 2019年10月29日, 招待, 英語, 青島, 中国
5. Analysis of gene expansion and expression profiles in the siphonous macroalga, Caulerpa lentillifera, Asuka Arimoto, Koki Nishitsuji, Noriyuki Satoh, Eiichi Shoguchi, 23rd International Seaweed Symposium 2019, 2019年05月03日, 通常, 英語, チェジュ, 韓国
6. Comparative genomics of Alphaproteobacteria associated with the dinoflagellate Symbiodiniaceae, Eiichi Shoguchi, Kanako Hisata, Koki Nishitsuji, Asuka Arimoto, Noriyuki Satoh, 23rd International Seaweed Symposium 2019, 2019年05月02日, 通常, 英語, チェジュ, 韓国
7. Draft genome of the brown alga, Nemacystus decipiens, Onna-1 strain: fusion genes related to sulfated fucan, Koki Nishitsuji, Asuka Arimoto, Noriyuki Satoh, Eiichi Shoguchi, 23rd International Seaweed Symposium 2019, 2019年05月02日, 通常, 英語, チェジュ, 韓国

受賞

1. 2020年09月04日, Zoological Science Award 2020, 日本動物学会
2. 2020年01月23日, 第41回沖縄研究奨励賞, 公益財団法人沖縄協会
3. 2011年09月22日, Zoological Science Award 2011, 日本動物学会

外部資金

競争的資金等の採択状況

1. 科学研究費助成事業 基盤研究（C）, Brachyury 発現細胞のシングルセル解析から左右相称動物の口と肛門の進化に迫る, 2023年04月01日, 2026年03月31日
2. 科学研究費助成事業 若手研究, 多核巨大単細胞生物のRNA局在を支える部位特異的な転写および核外輸送の検証, 2022年04月01日, 2025年03月31日
3. 科学研究費助成事業 研究成果公開促進費, 巨大な単細胞生物：形づくりの不思議, 2022年04月01日, 2022年08月22日
4. 科学研究費助成事業 若手研究, 巨大単細胞海藻クビレズタにおける翻訳後生体分子の局在解析による形態形成機構の解明, 2019年04月01日, 2022年03月31日
5. 科学研究費助成事業 研究成果公開促進費, 巨大な単細胞生物：形づくりの不思議, 2021年04月01日, 2021年10月17日

社会活動

委員会等委員歴

1. 非常勤講師, 2023年04月, 2023年09月, 放送大学広島学習センター
2. 非常勤講師, 2021年04月, 2021年09月, 放送大学広島学習センター
3. 中国四国支部会計幹事, 2022年, 日本動物学会

学術雑誌論文査読歴

1. 2021年, G3: Genes|Genomes|Genetics, その他, 査読者, 1
2. 2021年, BMC Genomics, その他, 査読者, 1
3. 2020年, BMC Genomics, その他, 査読者, 1
4. 2019年, BMC Genomics, その他, 査読者, 2