岡村 好子YOSHIKO OKAMURA

Last Updated :2019/02/01

所属・職名
大学院先端物質科学研究科 分子生命機能科学講座 准教授
メールアドレス
okamurayhiroshima-u.ac.jp

基本情報

主な職歴

  • 2011年01月01日, 広島大学, 大学院先端物質科学研究科, 准教授

学位

  • 博士(工学) (東京農工大学)
  • 修士(教育学) (東京学芸大学)

教育担当

  • 工学部:第三類(応用化学・生物工学・化学工学系), 先端物質科学研究科:分子生命機能科学専攻, 先端物質科学研究科:分子生命機能科学専攻

担当主専攻プログラム

  • 生物工学プログラム

研究分野

  • 化学 / 複合化学 / 生体関連化学
  • 工学 / プロセス・化学工学 / 生物機能・バイオプロセス
  • 総合生物 / ゲノム科学 / ゲノム生物学

研究キーワード

  • マリンバイオテクノロジー
  • バイオミネラリゼーション
  • 微生物ゲノム
  • メタゲノム
  • 光合成細菌

所属学会

教育活動

授業担当

  1. 2018年, 学部専門, セメスター(前期), 生物工学実験I
  2. 2018年, 学部専門, 4ターム, 遺伝子・タンパク質工学
  3. 2018年, 修士課程・博士課程前期, セメスター(前期), 分子生命機能科学セミナー
  4. 2018年, 修士課程・博士課程前期, セメスター(後期), 分子生命機能科学セミナー
  5. 2018年, 修士課程・博士課程前期, 通年, 分子生命機能科学特別研究Ⅰ
  6. 2018年, 修士課程・博士課程前期, 年度, 分子生命機能科学特別研究Ⅰ
  7. 2018年, 博士課程・博士課程後期, 年度, 分子生命機能科学特別研究Ⅱ

研究活動

学術論文(★は代表的な論文)

  1. ★, RNase H-assisted RNA-primed rolling circle amplification for targeted RNA sequence detection, SCIENTIFIC REPORTS, 8巻, pp.7770, 20180517
  2. Decomposition kinetics of uronic acids obtained from kelp under hydrothermal condition, Journal of the Energy Institute, 90巻, pp.185-pp.190, 2017
  3. In-situ mass spectroscopic analysis of glucose decomposition under hydrothermal condition: Quantitative analysis for reaction kinetics, Journal of the Japan Petroleum Institute, 60巻, pp.101-pp.109, 2017
  4. In situ mass spectrometry of glucose decomposition under hydrothermal reactions, KOREAN JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING, 34巻, 5号, pp.1524-pp.1530, 201705
  5. Kinetics of sorbitol decomposition under hydrothermal condition, Journal of Japan Petroleum Institute, 59巻, pp.149-pp.154, 2016
  6. Decomposition kinetics of mannose, its sugar alcohol, and its uronic acid under hydrothermal condition., Journal of Chemical Engineering of Japan, 49巻, pp.663-pp.667, 2016
  7. Development of a bench-top extra-cleanroom for DNA amplification., Bio Techniques, 61巻, 1号, pp.42-pp.46, 201607
  8. Isolation and characterization of bacterium producing lipid from short-chain fatty acids, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 201巻, pp.215-pp.221, 201602
  9. Semi-continuous methane production from undiluted brown algae using a halophilic marine microbial community, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 200巻, pp.616-pp.623, 201601
  10. High-rate Fermentation of Acetate to Methane under Saline Condition by Aceticlastic Methanogens Immobilized in Marine Sediment, PEDIATRIC NEUROLOGY, 55巻, pp.9-pp.15, 201602
  11. Characterization of a halotolerant acetoclastic methanogen highly enriched from marine sediment and its application in removal of acetate, JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 121巻, 2号, pp.196-pp.202, 201602
  12. Bacterial community structure and predicted alginate metabolic pathway in an alginate-degrading bacterial consortium, JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 121巻, 3号, pp.286-pp.292, 201603
  13. Characterization of a novel gene involved in cadmium accumulation screened from sponge-associated bacterial metagenome., Gene, 576巻, pp.618-pp.625, 2016
  14. Development of a bench-top extra-cleanroom for DNA amplification, BIOTECHNIQUES, 61巻, 1号, pp.42-pp.46, 201607
  15. Kinetics of Sorbitol Decomposition under Hydrothermal Condition, JOURNAL OF THE JAPAN PETROLEUM INSTITUTE, 59巻, 4号, pp.149-pp.154, 201607
  16. Decomposition Kinetics of Mannose, Its Sugar Alcohol, and Its Uronic Acid under Hydrothermal Condition, JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING OF JAPAN, 49巻, 7号, pp.663-pp.667, 201607
  17. Improved methane production from brown algae under high salinity by fed-batch acclimation, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 187巻, pp.275-pp.281, 201507
  18. Determination of Mannitol Decomposition Rate under Hydrothermal Pretreatment Condition, JOURNAL OF THE JAPAN PETROLEUM INSTITUTE, 58巻, 4号, pp.252-pp.255, 201507
  19. Effect of Salinity on Methanogenic Propionate Degradation by Acclimated Marine Sediment-Derived Culture, APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY, 177巻, 7号, pp.1541-pp.1552, 201512
  20. Dysgonomonas alginatilytica sp nov., an alginate-degrading bacterium isolated from a microbial consortium, INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 65巻, pp.3570-pp.3575, 201510
  21. 1細胞ゲノミックスの為の試薬と環境, THE CHEMICAL TIMES, 238巻, 4号, pp.22-pp.27, 2015
  22. Selenium recovery and conversion by a Filamentous Fungus, Aspergillus oryzae Strain RIB40, Asia Pacific Journal of Sustainable Agriculture Food and Energy, 2巻, 2号, pp.5-pp.8, 2014
  23. Evaluation of marine sediments as microbial sources for methane production from brown algae under high salinity, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 169巻, pp.362-pp.366, 201410
  24. Value-added lipid production from brown seaweed biomass by two-stage fermentation using acetic acid bacterium and thraustochytrid, APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 98巻, 22号, pp.9207-pp.9216, 201411
  25. Behavior of organics in kelp during hydrothermal pretreatment: Fundamental characteristics and effect of salt, Journal of the Japan Institute of Energy, 93巻, pp.531-pp.535, 2014
  26. 小さな生き物の大きな仕事, 生物工学会誌, 91巻, 3号, pp.155-pp.155, 2013
  27. Isolation and characterization of a GDSL esterase from the metagenome of a marine sponge-associated bacteria, Marine Biotechnology, 12巻, pp.395-pp.402, 201011
  28. Whole genome sequence of Desulfovibrio magneticus strain RS-1 revealed common gene clusters in magnetotactic bacteria, Genome Research, 19巻, pp.1801-pp.1808, 2009
  29. Cellular response to electrochemical killing process by applying a constant potential in synchronously cultured Saccharomyces cerevisiae, Electrochemistry, 76巻, pp.603-pp.605, 2008
  30. Development of cell surface display system in a Magnetotactic bacterium, Magnetospirillum magneticum AMB-1, Applied and Environmental Microbiology, 74巻, pp.3342-pp.3348, 2008
  31. Cytoplasmic ATPase involved in ferrous ion uptake from magnetotactic bacterium Magnetospirillum magneticum AMB-1, FEBS Letter, 581巻, pp.3443-pp.3448, 2007
  32. Origin of Magnetosome Membrane: Proteomic Analysis of Magnetosome Membrane and Comparison with Cytoplasmic Membrane, Proteomics, 6巻, pp.5234-pp.5247, 2006
  33. Global gene expression analysis of iron-inducible genes in Magnetospirillum magneticum AMB-1, Journal of Bacteriology, 188巻, pp.2275-pp.2279, 2006
  34. Dynamic analysis of genomeic island in Magnetospirillum sp. strain AMB-1 reveals how magnetosome synthesis developed, FEBS Letter, 580巻, pp.801-pp.812, 2006
  35. Complete genome sequence of the facultative anaerobic magnetotactic bacterium Magnetospirillum sp. strain AMB-1, DNA Research, 12巻, pp.157-pp.166, 2005
  36. “抗原を分解する抗体”の展開〜Antigenaseの発見と展望〜, 科学, 75巻, 11号, pp.1254-pp.1259, 2005
  37. Siderophore Production of a Periplasmic Transport Bionding Protein Kinase Gene Defective Mutant of Magnetospirillum magneticum AMB-1, Biochemical and Biophysical Research Communication, 323巻, pp.852-pp.857, 2004
  38. Assembly of G protein-coupled receptors onto nanosized bacterial magnetic particles using Mms16 as an anchor molecule, Applied and Environmental Microbiology, 70巻, pp.2880-pp.2885, 2004
  39. Biotechnological Application of Nano-Scale Engineered Bacterial Magnetic Particles, Journal of Materials Chemistry, 14巻, pp.2099-pp.2105, 2004
  40. Design and application of a new cryptic-plasmid-based shuttle vector for Magnetospirillum magneticum, Applied and Environmental Microbiology, 69巻, pp.4274-pp.4277, 2003
  41. Characterization of aldehyde ferredoxin oxidoreductase gene defective mutant in Magnetospirillum magneticum AMB-1, Biochemical and Biophysical Research Communication, 303巻, pp.223-pp.229, 2003
  42. Siderophore production by the magnetic bacterium Magnetospirillum magneticum AMB-1., FEMS Microbiology Letter, 218巻, pp.371-pp.375, 2003
  43. Genes and proteins involved in bacterial magnetic particle formation, Trends in Microbiology, 11巻, 11号, pp.536-pp.541, 2003
  44. MAGNETIC BACTERIA AND THEIR APPLICATIONS, Biomolecular Engineering, 20巻, 2号, pp.49-pp.49, 2003
  45. Bionanomagnet and its application, International Journal of Nanoscience, 1巻, 5 & 6号, pp.1-pp.7, 2002
  46. Molecular mechanism of bacterial magnetite formation and its application, Material Research Society Symposium Proceeding, 724巻, pp.N.1.4.1., 2002
  47. ナノバイオテクノロジーの展望, バイオインダストリー, 19巻, 3号, pp.46-pp.51, 2002
  48. Molecular mechanism of magnetosome formation in Magnetospirillum magneticum AMB-1, BIOMINERALIZATION (BIOM2001) formation, diversity, evolution and application, pp.272-pp.276
  49. A magnetosome specific GTPase from the magnetic bacterium Magnetospirillum magneticum AMB-1, Journal of Biological Chemistry, 276巻, pp.48183-pp.48188, 2001
  50. Cloning and characterization of a gene, mpsA, encoding a protein associated with intracellular magnetic particles from Magnetospirillum sp. strain AMB-1, Biochemical and Biophysical Research Communication, 268巻, pp.932-pp.937, 2000
  51. Two-dimensional analysis of proteins specific to the bacterial magnetic particle membrane from Magnetospirillum sp. AMB-1, Applied Biochemistry and Biotechnology, 84-86巻, pp.441-pp.446, 2000
  52. Identification of the gene cluster involved in ferredoxin in the flanking region of transposon from non-magnetic mutant of Magnetospirillum sp. AMB-1, Proceeding of "8th INTERNATIONAL CONFERENCE ON FERRITES, pp.84-pp.86, 2000
  53. 磁性細菌のキャラクタリゼーションと応用, O plus E, 21巻, 10号, pp.1271-pp.1276, 1999
  54. Role of carbonic anhydrase in photosynthesis of unicellular marine algae coccolithophorids (Haptophyta)., Research in photosynthesis, 3巻, pp.783-pp.786, 1992
  55. Real-Time Mass Spectrometric Analysis of Hydrothermal Reaction Products, INDUSTRIAL & ENGINEERING CHEMISTRY RESEARCH, 56巻, 36号, pp.9993-pp.9998, 20170913
  56. Improved methanization and microbial diversity during batch mode cultivation with repetition of substrate addition using defined organic matter and marine sediment inoculum at seawater salinity, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 245巻, pp.833-pp.840, 201712
  57. Quantitative In Situ Mass Spectrometry Analysis of Mannitol Decomposition Products under Hydrothermal Conditions, ENERGY & FUELS, 31巻, 10号, pp.10866-pp.10873, 201710
  58. Efficient conversion of mannitol derived from brown seaweed to fructose for fermentation with a thraustochytrid, JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 125巻, 2号, pp.180-pp.184, 201802
  59. Isolation of High Carotenoid-producing Aurantiochytrium sp Mutants and Improvement of Astaxanthin Productivity Using Metabolic Information, JOURNAL OF OLEO SCIENCE, 67巻, 5号, pp.571-pp.578, 201805
  60. Biomineralization of metallic tellurium by bacteria isolated from marine sediment off Niigata Japan, Proceedings of BIOMIN XIV, 2018
  61. Potential of Nitratireductor sp. OM-1 to produce more short-chain esters and less excess sludge during wastewater treatment, Papers of the 26th European Biomass Conference, pp.917-pp.920, 201805

著書等出版物

  1. 2016年, Rolling Circle Amplification (RCA): Toward New Clinical Diagnostics and Therapeutics, Chapter 4. Use of DNA CircLigase for direct isothermal detection of microbial mRNAs by RNA-primed rolling circle amplification and preparation of ø29 DNA polymerase not contaminated by amplifiable DNA, Springer, 2016年, 2016, 単行本(学術書), 共著, 英語, Hirokazu TAKAHASHI, Yoshiko OKAMURA and Toshiro KOBORI, ISBN 978-3-319-42224-4, 176
  2. 2012年04月, 生命科学概論-環境・エネルギーから医療までー, 朝倉書店, 2012年, 04, 教科書, 共著, 9784254171518, 158
  3. 2012年03月, 遺伝子工学  基礎生物学的ストシリーズ10, 化学同人, 2012年, 03, 教科書, 共著, 9784759811100, 239
  4. 2011年01月, メタゲノム解析技術の最前線, シーエムシー, 2011年, 01, 単行本(一般書), 共編著, 2147483647, 231, 10
  5. 2010年03月, シングルセル解析の最前線, シーエムシー, 2010年, 単行本(一般書), 2147483647, 286, 7
  6. 2009年07月, マリンメタゲノムの有効利用, シーエムシー, 2009年, 単行本(一般書), 2147483647, 279, 10
  7. 2009年04月, メタルバイオテクノロジーによる環境保全と資源回収, シーエムシー, 2009年, 2147483647, 291, 8
  8. 2005年01月, Biomineralization: Progress in Biology, Molecular Biology and Application, WILEY-VCH, 2005年, 2147483647, 361
  9. 2005年06月, BIOMINERALIZATION (BIOM2001) formation, diversity, evolution and application, Tokai University Press, 2005年, 2147483647, 399, 5
  10. 2004年07月, バイオチップの最新技術と応用, シーエムシー, 2004年, 2147483647, 276
  11. 2004年03月, ナノバイオエンジニアリング —生命と物質の融合をめざして, 化学同人, 2004年, 2147483647, 192
  12. 1992年, Research in photosynthesis, Springer, 1992年, 2147483647, 3515, 4
  13. 2015年07月, バイオベース資源確保戦略 —都市鉱山・海底鉱山に眠る貴金属・レアメタル等の分離回収技術—, 2015年, 07, 単行本(学術書), 共著, 978-4-7813-1075-6

招待講演、口頭・ポスター発表等

  1. Lipid production from VFAs derived from marine biomass by oleaginous bacterium, Yoshiko Okamura, 2017 Japan-Danish Workshop on Biomass Research, 2017年03月08日, 招待, 英語, Copenhagen, Denmark
  2. 細菌のミネラリゼーション, 岡村好子, 第19回マリンバイオテクノロジー学会 シンポジウム3バイオミネラリゼーションにおける有機ー無機相互作用の分子メカニズムを利用した応用研究の最前線, 2017年06月04日, 招待, 日本語, 仙台市
  3. 標的RNAの新規な高精度識別方法RNase H-assisted RCA., 岡村好子, 第17回アカデミックフォーラム, 2018年06月28日, 招待, 日本語, リード エグジビション ジャパン 株式会社, 東京都江東区
  4. 海洋細菌を用いた資源リサイクルの展望, 岡村好子, 広島大学バイオマスプロジェクト研究センター主催シンポジウム「瀬戸内海を宝の海に~CREST最終報告とこれからの展開~」, 2018年09月27日, 招待, 日本語, 広島大学バイオマスプロジェクト研究センター, 広島市
  5. Oil production from organic acids derived from marine algal biomass by Nitratireductor sp. OM-1., Yoshiko Okamura, Shota Nakai, Tsunehiro Aki, Yutaka Nakashimada, Yukihiko Matsumura, Takahisa Tajima., APMBC 2017, 2017年05月23日, 通常, 英語, Asia-Pacific Marine Biotechnology conference, Hawaii, USA
  6. Potential of Nitratireductor sp. OM-1 to produce more short-chain esters and less excess sludge during wastewater treatment., Yoshiko Okamura, EUBCE 2018, 2018年05月14日, 通常, 英語, European Biomass Conference & Exibition, Copenhagen, Denmark
  7. 廃液中の有機酸を利用したNitratireductor sp. OM-1による軽油生産, 登 祐介, 中井昇太、三浦豊和、高橋宏和、秋 庸裕、中島田 豊、松村 幸彦、岡村 好子, 第20回マリンバイオテクノロジー学会, 2018年05月26日, 通常, 日本語, バイオテクノロジー学会, 宮崎県
  8. mRNA直接検出のためのRNase H-assisted RCA法の開発, 堀尾京平, 大川内 雅彦、高橋 宏和、小堀 俊郎、秋 庸裕、松村 幸彦、中島田 豊、岡村 好子, 第20回マリンバイオテクノロジー学会, 2018年05月26日, 通常, 日本語, バイオテクノロジー学会, 宮崎県
  9. Nitratireductor sp. OM-1の軽油合成能の向上, 岡村好子, 中井昇太、高橋宏和、秋庸裕、松村幸彦、中島田豊, 第20回マリンバイオテクノロジー学会, 2018年05月26日, 通常, 日本語, マリンバイオテクノロジー学会, 宮崎県
  10. Removal of ammonium, inhibitor of biodiesel production in Nitratireductor sp. OM – 1, toward wastewater utilization, Yusuke Noboru, Hirokazu Takahashi, Tsunehiro Aki, Yutaka Nakashimada, Yukihiko Matsumura, Yifeng Zhang, Irini Angelidaki, Yosiko Okamura, International Symposium on Fuel and Energy 2018, 2018年06月06日, 通常, 英語, 広島県東広島市
  11. 複合系中の標的mRNA直接検出法の開発, 堀尾 京平, 大川内 雅彦, 高橋 宏和, 小堀 俊郎, 秋 庸裕, 松村 幸彦, 中島田 豊, 岡村 好子, 第70回生物工学会, 2018年09月05日, 通常, 日本語, 日本生物工学会, 大阪府
  12. Nitratireductor sp. OM-1の軽油生産におけるアンモニウムの影響, 登 祐介, 高橋 宏和 、秋 庸裕 、中島田 豊 、松村 幸彦 、岡村 好子, 第70回日本生物工学会, 2018年09月06日, 通常, 日本語, 大阪府
  13. Characteristics of biogenic PbS towards future fabrication of biogenic semiconductor devices, Yoriko Tominaga, Ryo Shimizu, Sachiko Maki, Makoto Maeda, Yoshiko Okamura, 第3回生体医歯工学共同研究拠点国際シンポジウム, 2018年11月08日, 通常, 英語, Hiroshima, Japan
  14. Characteristics of biogenic sulfide semiconductor nanomaterials, Yoriko Tominaga, Ryo Shimizu, Sachiko Maki, Makoto Maeda, Yoshiko Okamura, Material Research Society Fall Meeting 2018, 2018年11月26日, 通常, 英語, Material Research Society, Boston MA, USA
  15. 細菌による化合物半導体の合成, 岡村好子, 広島大学 新技術説明会, 2018年10月11日, 招待, 日本語, JST東京本部別館1Fホール

受賞

  1. 2005年, 日本化学会第86春季年会優秀講演賞, 公益社団法人 日本化学会, 炎症性サイトカインTNF-αに対するAntigenaseの開発
  2. 2002年, Young Investigator Award, Gordon Research Conference on Biomineralization conference 2002, Molecular Mechanism of Bacterial Magnetite Formation

社会活動

委員会等委員歴

  1. 英文誌編集委員会委員, 2013年06月, 2017年05月, 公益社団法人 日本生物工学会
  2. 日本生物工学会 代議員, 2009年06月, 2017年05月, 公益社団法人 日本生物工学会
  3. マリンバイオテクノロジー学会評議員, 2013年04月, 2017年03月, マリンバイオテクノロジー学会

その他社会貢献活動(広大・部局主催含)

  1. 文部科学省科学技術人材育成費補助事業 女性研究者研究活動支援事業(拠点型)第2回女性研究者研究交流会, 未知・未培養微生物の遺伝子資源の利用, 広島大学男女共同参画推進室