米澤 隆弘TAKAHIRO YONEZAWA

Last Updated :2024/12/23

所属・職名
大学院統合生命科学研究科　教授
メールアドレス
tyonezawhiroshima-u.ac.jp

基本情報

主な職歴

  • 2007年04月, 2011年09月, 復旦大学, 講師
  • 2011年10月, 2018年03月, 復旦大学, 准教授
  • 2018年04月, 2023年03月, 東京農業大学, 准教授
  • 2023年04月01日, 広島大学, 大学院統合生命科学研究科, 教授

学歴

  • 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 生命体科学専攻博士課程, 日本, 2004年04月, 2007年03月
  • 東京大学, 大学院理学系研究科, 生物科学専攻修士課程, 日本, 2002年04月, 2004年03月
  • 早稲田大学, 教育学部, 理学科地球科学専修, 日本, 1998年04月, 2002年03月

学位

  • 修士（理学）　(東京大学)
  • 博士（理学）　(総合研究大学院大学)

研究分野

  • 農学 / 生産環境農学 / 遺伝育種科学
  • 生物学 / 基礎生物学 / 生物多様性・分類
  • 生物学 / 基礎生物学 / 進化生物学
  • 総合生物 / ゲノム科学 / ゲノム生物学

研究キーワード

  • 分子進化、集団遺伝、分子系統、ゲノム、育種、ニワトリ

所属学会

  • 生き物文化誌学会
  • 日本動物遺伝育種学会
  • 日本家禽学会
  • 日本哺乳類学会
  • 日本進化学会

教育活動

授業担当

  1. 2024年, 学部専門, ４ターム, 動物遺伝育種学
  2. 2024年, 学部専門, 集中, 動物生産学実験I
  3. 2024年, 学部専門, ２ターム, 応用動植物科学外書講読
  4. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, 卒業論文I
  5. 2024年, 学部専門, セメスター（前期）, 卒業論文II
  6. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, 卒業論文III
  7. 2024年, 学部専門, 集中, (AIMS) Introduction Physiology of Domestic Animals
  8. 2024年, 学部専門, 集中, Introductory Physiology of Domestic Animals
  9. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ２ターム, 家畜生産機能学Ⅰ
  10. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ４ターム, 家畜生産機能学Ⅱ

研究活動

学術論文（★は代表的な論文）

  1. Molecular phylogenetic in the origin and propagation route of Madagascar pigs, DNA 多型, 32巻, 1号, pp. 45-47, 2024
  2. Maternal genetic phylogeography analysis of Kyrgyz native cattle, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 95巻, 1号, 202401
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  3. Conserved genetic background but geographically differentiated DNA methylation patterns in invasive alligator weed (Alternanthera philoxeroides) populations of China and Japan, BIOLOGICAL INVASIONS, 26巻, 7号, pp. 2351-2365, 202407
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  4. ★, Origin and spatial population structure of Malagasy native chickens based on mitochondrial DNA, SCIENTIFIC REPORTS, 14巻, 1号, 20240104
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  5. Phylogenomic analyses of Camellia support reticulate evolution among major clades., Molecular phylogenetics and evolution, 182巻, 2023
  6. Climate heterogeneity shapes phylogeographic pattern of Hippophae gyantsensis (Elaeagnaceae) in the east Himalaya-Hengduan Mountains., Ecology and evolution, 13巻, 6号, 2023
  7. Evolution of snow algae, from cosmopolitans to endemics, revealed by DNA analysis of ancient ice., The ISME journal, 17巻, 4号, 2023
  8. ★, Complete Mitochondrial Genome Analysis Clarifies the Enigmatic Origin of Haplogroup D in Japanese Native Chickens., The journal of poultry science, 59巻, 4号, 2022
  9. Comprehensive assessment of genetic diversity, structure, and relationship in four Japanese cattle breeds by Illumina 50 K SNP array analysis., Animal science journal = Nihon chikusan Gakkaiho, 93巻, 1号, 2022
  10. Phylogenomics and Spatiotemporal Dynamics of Bovine Leukemia Virus Focusing on Asian Native Cattle: Insights Into the Early Origin and Global Dissemination., Frontiers in microbiology, 13巻, 2022
  11. ★, Paleogenomics reveals independent and hybrid origins of two morphologically distinct wolf lineages endemic to Japan., Current biology : CB, 32巻, 11号, 2022
  12. Molecular Evolutionary Rate Predicts Intraspecific Genetic Polymorphism and Species-Specific Selection., Genes, 13巻, 4号, 2022
  13. Fine-scale genetic diversity and putative ecotypes of oxymonad protists coinhabiting the hindgut of Reticulitermes speratus., Molecular ecology, 31巻, 4号, 2022
  14. Comparative morphological study of skeletal muscle weight among the red jungle fowl (Gallus gallus) and various fowl breeds (Gallus domesticus)., Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution, 338巻, 8号, 2022
  15. Ancient DNA reveals multiple origins and migration waves of extinct Japanese brown bear lineages., Royal Society open science, 8巻, 8号, 2021
  16. Evolution of Reproductive Life History in Mammals and the Associated Change of Functional Constraints., Genes, 12巻, 5号, 2021
  17. Concerted and birth-and-death evolution of 26S ribosomal DNA in Camellia L., Annals of botany, 127巻, 1号, 2021
  18. Complete mitochondrial genome sequence of Tosa-Jidori sheds light on the origin and evolution of Japanese native chickens., Animal bioscience, 34巻, 6号, 2021
  19. Cattle mitogenome variation reveals a post-glacial expansion of haplogroup P and an early incorporation into northeast Asian domestic herds., Scientific reports, 10巻, 1号, 2020
  20. Indonesian native goats (Capra hircus) reveal highest genetic frequency of mitochondrial DNA haplogroup B in the world., Animal science journal = Nihon chikusan Gakkaiho, 91巻, 1号, 2020
  21. Evaluation of reported sediment samples from 20 Ma using a molecular phylogenetic approach: comment on Liu et al. (2017)., Environmental microbiology, 22巻, 3号, 2020
  22. Phylogeographic Analysis of Madagascan Goats Using mtDNA Control Region and SRY Gene Sequences., Zoological science, 36巻, 4号, 2019
  23. Maternal phylogeographic patterns and coalescent times of Arabidopsis thaliana based on chloroplast DNA analyses., Genes & genetic systems, 94巻, 4号, 2019
  24. An improved metagenomic strategy reveals an unprecedentedly high level of intragenomic polymorphism of ribosomal DNA in three species of Camellia, Journal of Systematics and Evolution, 56巻, 3号, pp. 250-258, 20180501
  25. Bipolar dispersal of red-snow algae., Nature communications, 9巻, 1号, 2018
  26. Demographic analysis of cyanobacteria based on the mutation rates estimated from an ancient ice core., Heredity, 120巻, 6号, 2018
  27. Discovery of A high-altitude ecotype and ancient lineage of Arabidopsis thaliana from Tibet., Science bulletin, 62巻, 24号, 2017
  28. Biogeography of cryoconite forming cyanobacteria on polar and Asian glaciers, Journal of Biogeography, 44巻, 12号, pp. 2849-2861, 20171201
  29. Rates of Molecular Evolution Suggest Natural History of Life History Traits and a Post-K-Pg Nocturnal Bottleneck of Placentals., Current biology : CB, 27巻, 19号, 2017
  30. Phylogeography of Sophora moorcroftiana Supports Wu's Hypothesis on the Origin of Tibetan Alpine Flora., The Journal of heredity, 108巻, 4号, 2017
  31. ★, Phylogenomics and Morphology of Extinct Paleognaths Reveal the Origin and Evolution of the Ratites., Current biology : CB, 27巻, 1号, 2017
  32. Cretaceous origin of giant rhinoceros beetles (Dynastini; Coleoptera) and correlation of their evolution with the Pangean breakup., Genes & genetic systems, 91巻, 4号, 2017
  33. Origin and genetic diversity of Egyptian native chickens based on complete sequence of mitochondrial DNA D-loop region., Poultry science, 95巻, 6号, 2016
  34. The genome and transcriptome of Trichormus sp. NMC-1: insights into adaptation to extreme environments on the Qinghai-Tibet Plateau., Scientific reports, 6巻, 2016
  35. Evaluating the Phylogenetic Status of the Extinct Japanese Otter on the Basis of Mitochondrial Genome Analysis., PloS one, 11巻, 3号, 2016
  36. Compression-only CPR training in elementary schools and student attitude toward CPR., Pediatrics international : official journal of the Japan Pediatric Society, 58巻, 8号, 2016
  37. Speciation of two gobioid species, Pterogobius elapoides and Pterogobius zonoleucus revealed by multi-locus nuclear and mitochondrial DNA analyses., Gene, 576巻, 2 Pt 1号, 2016
  38. Phylogeographic and Demographic Analysis of the Asian Black Bear (Ursus thibetanus) Based on Mitochondrial DNA., PloS one, 10巻, 9号, 2015
  39. Polymorphism and evolution of ribosomal DNA in tea (Camellia sinensis, Theaceae)., Molecular phylogenetics and evolution, 89巻, 2015
  40. Transcriptome profiling of the UV-B stress response in the desert shrub Lycium ruthenicum., Molecular biology reports, 42巻, 3号, 2015
  41. Genetic population structure of the desert shrub species lycium ruthenicum inferred from chloroplast DNA, Pakistan Journal of Botany, 46巻, 6号, pp. 2121-2130, 20141201
  42. Importance of synonymous substitutions under dense taxon sampling and appropriate modeling in reconstructing the mitogenomic tree of Eutheria., Genes & genetic systems, 89巻, 5号, 2014
  43. Polyphyletic origins of schizothoracine fish (Cyprinidae, Osteichthyes) and adaptive evolution in their mitochondrial genomes., Genes & genetic systems, 89巻, 4号, 2014
  44. Extreme nearly neutral evolution in mitochondrial genomes of laboratory mouse strains., Gene, 534巻, 2号, 2014
  45. Utility of the phylotoxigenic relationships among trichothecene-producing Fusarium species for predicting their mycotoxin-producing potential, Food Additives and Contaminants - Part A, 30巻, 8号, pp. 1370-1381, 20130101
  46. Domestication process of the goat revealed by an analysis of the nearly complete mitochondrial protein-encoding genes., PloS one, 8巻, 8号, 2013
  47. Complete chloroplast genome sequence of holoparasite Cistanche deserticola (Orobanchaceae) reveals gene loss and horizontal gene transfer from its host Haloxylon ammodendron (Chenopodiaceae)., PloS one, 8巻, 3号, 2013
  48. High altitude adaptation of the schizothoracine fishes (Cyprinidae) revealed by the mitochondrial genome analyses., Gene, 517巻, 2号, 2013
  49. Phylogenetic position and evolutionary history of the turtle and whale barnacles (Cirripedia: Balanomorpha: Coronuloidea)., Molecular phylogenetics and evolution, 67巻, 1号, 2013
  50. Phylogeny and biogeography of highly diverged freshwater fish species (Leuciscinae, Cyprinidae, Teleostei) inferred from mitochondrial genome analysis., Gene, 514巻, 2号, 2013
  51. The yak genome and adaptation to life at high altitude., Nature genetics, 44巻, 8号, 2012
  52. Some problems in proving the existence of the universal common ancestor of life on Earth., TheScientificWorldJournal, 2012巻, 2012
  53. Coxa morphologically adapted to large egg in aepyornithid species compared with various palaeognaths, Journal of Veterinary Medicine Series C: Anatomia Histologia Embryologia, 41巻, 1号, pp. 31-40, 20120201
  54. Molecular phylogeny of the higher and lower taxonomy of the Fusarium genus and differences in the evolutionary histories of multiple genes., BMC evolutionary biology, 11巻, 2011
  55. Why does the giant panda eat bamboo? A comparative analysis of appetite-reward-related genes among mammals., PloS one, 6巻, 7号, 2011
  56. The semifossorial function of the forelimb in the common rice tenrec (Oryzorictes hova) and the streaked tenrec (Hemicentetes hemispinosus), Journal of Veterinary Medicine Series C: Anatomia Histologia Embryologia, 36巻, 6号, pp. 413-418, 20071201
  57. Evaluation of genetic markers for identifying isolates of the species of the genus Fusarium., Journal of the science of food and agriculture, 91巻, 13号, 2011
  58. Domestication relaxed selective constraints on the yak mitochondrial genome., Molecular biology and evolution, 28巻, 5号, 2011
  59. ★, Was the universal common ancestry proved?, Nature, 468巻, 7326号, 2010
  60. The position of gnetales among seed plants: overcoming pitfalls of chloroplast phylogenomics., Molecular biology and evolution, 27巻, 12号, 2010
  61. A quill vibrating mechanism for a sounding apparatus in the streaked tenrec (Hemicentetes semispinosus)., Zoological science, 27巻, 5号, 2010
  62. Chronology of the extant African elephant species and case study of the species identification of the small African elephant with the molecular phylogenetic method., Gene, 441巻, 1-2号, 2009
  63. Episodic evolution and adaptation of chloroplast genomes in ancestral grasses., PloS one, 4巻, 4号, 2009
  64. The monophyletic origin of sea lions and fur seals (Carnivora; Otariidae) in the Southern Hemisphere., Gene, 441巻, 1-2号, 2009
  65. A case study of the molecular genetical diagnosis of a small African Elephant (Loxodonta sp.) "Nana" kept at Asahiyama Zoo, Mammal Study, 34巻, 3号, pp. 171-177, 20090901
  66. Molecular systematics and evolution of the recently discovered "Parnassian" butterfly (Parnassius davydovi Churkin, 2006) and its allied species (Lepidoptera, Papilionidae)., Gene, 441巻, 1-2号, 2009
  67. Molecular phylogenetic study on the origin and evolution of Mustelidae., Gene, 396巻, 1号, 2007
  68. The adaptational strategies of the hindlimb muscles in the Tenrecidae species including the aquatic web-footed tenrec (Limnogale mergulus)., Annals of anatomy = Anatomischer Anzeiger : official organ of the Anatomische Gesellschaft, 188巻, 4号, 2006

著書等出版物

  1. Phylogeographic History of Plants and Animals Coexisting with Humans in Asia, Molecular Phylogeographic Analyses Provide a New Perspective on the Evolutionary Origin and History of Japanese Native Chickens, 2024年, 10, 単行本（学術書）, 分担執筆, English, ISBN-10 ‏ : ‎ 9819768861
    Amazon 画像リンク（小）
  2. 2022年, Web連携テキストバイオインフォマティクス : 基礎から応用, 培風, 門田幸二 [ほか] 編著, 9784563078324
  3. 2020年, 日本の鰭脚類 : 海に生きるアシカとアザラシ = Pinnipeds in Japan, 東京大学出版, 服部薫編, 9784130602396
  4. 2010年, 日本列島の野生生物と人, 世界思想, 池谷和信編, 9784790714712

招待講演、口頭・ポスター発表等

  1. 世界を変えた奇跡の動物　～DNAから解き明かす家畜の起源と歴史～, 米澤隆弘, 第26回日本進化学会神奈川大会・一般市民公開講座形「DNA・行動から動物の進化をさぐるー恐竜からニワトリ・クジラ」, 招待, 日本語
    Related URL
  2. 全ゲノム解析に基づく東アジア北部の家畜ヤクの起源と伝播経路の推定, 米澤隆弘, 山本義雄, 西堀正英, 動物遺伝育種学会第24回大会, 2023年11月18日, 通常, 日本語
  3. Population genomic analysis unveils the origins and histories of Japanese native chickens, Takahiro Yonezawa, 日本遺伝学会第95回大会国際シンポジウム GSA-GSJ Joint Symposium　「Evolutionary Genetics in the Genomic Era: Understanding Biological Diversity」, 招待, 英語
  4. マダガスカルのホロホロチョウは自然分布か？　―集団ゲノム解析からのアプローチ―, 米澤隆弘・山本義雄・西堀正英, 生き物文化誌学会第20回学術大会東京大会, 2023年06月25日, 通常, 日本語

受賞

  1. 2024年11月29日, 日本DNA多型学会若手研究賞, 日本DNA多型学会, 中国地方におけるニホンリス(Sciurus lis)の分子系統学的研究およびモニタリング手法の開発
    Related URL
  2. 2023年, 日本DNA多型学会若手研究賞, 日本DNA多型学会, マダガスカル豚の起源および伝播経路における分子系統学的解析
  3. 2018年04月17日, 科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞, 文部科学省
  4. 2017年08月26日, 日本進化学会研究奨励賞

外部資金

競争的資金等の採択状況

  1. 科研費 学術変革領域研究(A), 日本在来家畜起源論の改新に向けた集団ゲノム解析からの展開, 2024年, 2025年
  2. 科研費 基盤研究(B), アジアにおける低生産性在来鶏から耐暑性および抗病性関連遺伝子を網羅的に探索する, 2024年, 2027年
  3. 科研費 基盤研究(B), 全ゲノム情報によるアジア在来ヤギの包括的研究－東南アジアヤギの新起源と伝播経路－
  4. 科研費 基盤研究(B), 哺乳類の大進化に寄与した非コード領域の検出と表現型の進化史の予測, 2022年, 2024年
  5. 科研費　 挑戦的研究(萌芽), モンゴル在来馬を用いたウマの家畜化の起源の解明, 2023年, 2025年
  6. 科研費　 基盤研究(A), 生命受容に基づく人間家畜相互関係の成立と深化に関する学融合的パラダイムシフト, 2022年, 2026年
  7. 科研費　基盤研究(B), 適応放散のメカニズムを解明する―分散力の進化的変化に注目して, 2022年, 2025年
  8. 科研費　基盤研究(C), GWAS, ゲノム, (古)環境に基づく多形質共適応・共進化マップの構築, 2022年, 2025年
  9. 科研費　基盤B, アイスコアの古代ゲノム解析が解き明かす気候変動と雪氷性シアノバクテリア群集変遷史, 2021年, 2023年
  10. 科研費　基盤研究(B), 東アジア牛は野生牛から遺伝子流入を受けたのか？－その遺伝構造と伝播経路の解明―, 2021年, 2023年
  11. 科研費　国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)), 家畜のインド洋海上伝播を解明するための国際共同調査研究, 2021年, 2025年
  12. 科研費　 挑戦的研究(萌芽), 古代DNA研究が切り開く更新世の絶滅大型哺乳類の解明 研究課題, 2020年, 2022年
  13. 科研費　 挑戦的研究(萌芽), 全ゲノム情報を用いたヤギの起源と伝播、環境適応形質の包括的解明に向けた先駆的研究, 2019年, 2022年
  14. 科研費　基盤研究(A), ポスト古代ゲノム解読期における家畜化概念のヒューマンアニマルボンド的学融合刷新, 2019年, 2022年
  15. 科研費　基盤研究(A), 急激な環境変動にともなう氷河生物の繁殖域拡大要因の解明, 2019年, 2023年
  16. 科研費　基盤研究(A), 南極に保存された古代試料のゲノム解析による氷期サイクルの生物相変遷, 2018年, 2020年
  17. 科研費　基盤研究(B), マダガスカルでの遺伝子水平伝播パンデミックとヘビによる世界的な伝播因子拡散の実証, 2018年, 2022年
  18. 科研費　基盤研究(B), 中央アジアにおけるウシ科，ラクダ科家畜とその近縁種の遺伝資源学的調査研究, 2017年, 2019年
  19. 科研費　基盤研究(B), アイスコアに封じ込められた微生物ゲノムの変動解読, 2018年, 2019年
  20. 科研費　基盤研究(C), 分岐年代推定に関わる諸問題, 2013年, 2015年

社会活動

委員会等委員歴

  1. 動物遺伝育種学会理事, 2024年, 2026年
  2. 生き物文化誌学会常任理事, 2019年, 2025年, 生き物文化誌学会

学術雑誌論文査読歴

  1. 2024年, Mammal Study, 編集員
  2. 2024年, 哺乳類科学, 編集員