大木 駿SHUN OKI

Last Updated :2024/12/02

所属・職名
大学院医系科学研究科（医）　特任助教
メールアドレス
ohkishiroshima-u.ac.jp

基本情報

主な職歴

  • 2021年04月01日, 広島大学, 大学院医系科学研究科(医), 助教
  • 2020年04月01日, 2021年03月31日, アニコム先進医療研究所, 研究開発課, 研究員
  • 2018年09月01日, 2020年03月31日, 明治大学, 農学部, 博士研究員
  • 2017年02月01日, 2018年08月31日, 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任研究員
  • 2014年10月01日, 2017年01月31日, 沖縄綜合科学研究所, 研究開発課, 研究員

学歴

  • 琉球大学, 理工学研究科, 海洋環境学, 2008年04月01日, 2016年03月31日
  • 東邦大学, 理学部生物分子科学科, 生物分子科学科, 2004年04月01日, 2008年03月31日

学位

  • 修士（理学）　(琉球大学)
  • 博士（理学）　(琉球大学)

研究分野

  • 総合生物 / ゲノム科学 / ゲノム生物学
  • 生物学 / 生物科学 / 分子生物学
  • 生物学 / 基礎生物学 / 進化生物学

研究キーワード

  • バイオインフォマティクス

教育活動

授業担当

  1. 2024年, 修士課程・博士課程前期, セメスター（前期）, 特別演習
  2. 2024年, 修士課程・博士課程前期, セメスター（後期）, 特別演習
  3. 2024年, 修士課程・博士課程前期, セメスター（前期）, 特別研究
  4. 2024年, 修士課程・博士課程前期, セメスター（後期）, 特別研究
  5. 2024年, 博士課程・博士課程後期, セメスター（前期）, 特別演習
  6. 2024年, 博士課程・博士課程後期, セメスター（後期）, 特別演習
  7. 2024年, 博士課程・博士課程後期, セメスター（前期）, 特別研究
  8. 2024年, 博士課程・博士課程後期, セメスター（後期）, 特別研究
  9. 2024年, 博士課程・博士課程後期, セメスター（前期）, 免疫学特別演習
  10. 2024年, 博士課程・博士課程後期, セメスター（後期）, 免疫学特別演習
  11. 2024年, 博士課程・博士課程後期, セメスター（前期）, 免疫学特別研究
  12. 2024年, 博士課程・博士課程後期, セメスター（後期）, 免疫学特別研究

研究活動

学術論文（★は代表的な論文）

  1. Eed-dependent histone modification orchestrates the iNKT cell developmental program alleviating liver injury, Frontiers in Immunology, 15巻, pp. 1467774, 20240924
  2. Effect of the frequency of multi-specific synchronous spawning on genetic introgression among three Acropora species, Coral Reefs, 43巻, pp. 1497-1509, 20240829
  3. Loss of Tob1 promotes muscle regeneration through muscle stem cell expansion, Journal of Cell Science, 137巻, 15号, pp. jcs261886, 20240801
  4. Integrative taxonomic analyses reveal that rapid genetic divergence drives Acropora speciation, Molecular Phylogenetics and Evolution, 195巻, pp. 108063, 20240601
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  5. Speciation due to rapid genetic divergence in coding and noncoding regions accompanied by phenotypic differences in the tabular coral Acropora, SSRN, pp. 4656117, 20231109
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  6. Positive selection on ADAM10 builds species recognition in the synchronous spawning coral Acropora, Frontiers in Cell and Developmental Biology, 11巻, pp. 420, 20230420
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  7. Structural basis of spike RBM-specific human antibodies counteracting broad SARS-CoV-2 variants, COMMUNICATIONS BIOLOGY, 6巻, 1号, 20230411
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  8. Germinal center-derived broadly neutralizing antibodies adapt to SARS-CoV-2 antigenic drift, bioRxiv, pp. 2022.01. 26.477937, 20220127
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  9. Vaccination with the Omicron spike RBD boosts broadly neutralizing antibody levels and confers sustained protection even after acquiring immunity to the original antigen, INTERNATIONAL IMMUNOLOGY, 35巻, 4号, pp. 197-207, 20230404
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  10. Concomitant Cytotoxic Effector Differentiation of CD4+ and CD8+ T Cells in Response to EBV-Infected B Cells, Cancers, 14巻, 17号, pp. 4118, 20220825
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  11. Differences in spawning time drive cryptic speciation in the coral Acropora divaricata., Marine Biology, 167巻, 11号, pp. 1-10, 202011
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  12. A highly flexible and repeatable genotyping method for aquaculture studies based on target amplicon sequencing using next-generation sequencing technology, Scientific Reports, 9巻, 1号, pp. 1-9, 201905
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  13. Complete genome sequence of carotenoid-producing Enterococcus gilvus CR1, isolated from raw cow's milk, Microbiology Resource Announcements, 7巻, 10号, 201809
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  14. Complete Genome Sequence of Lactobacillus paracasei EG9, a Strain Accelerating Free Amino Acid Production during Cheese Ripening, Genome Announcements, 6巻, 27号, 201807
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  15. Complete genome sequence of Lactobacillus plantarum strain LQ80, selected for preparation of fermented liquid feed for pigs, Genome Announcements, 6巻, 25号, 201806
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  16. Complete Genome Sequence of Petrimonas sp. Strain IBARAKI, Assembled from the Metagenome Data of a Culture Containing Dehalococcoides spp., Genome Announcements, 6巻, 18号, 201805
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  17. Complete genome sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis G50 with immunostimulating activity, isolated from napier grass, Genome Announcements, 6巻, 8号, 201802
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  18. Advantages of genome sequencing by long-read sequencer using SMRT technology in medical area, Human Cell, 30巻, 3号, 201707
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  19. Isolation and genomic characterization of a Dehalococcoides strain suggests genomic rearrangement during culture, Scientific Reports, 7巻, 1号, 201705
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  20. First Complete Genome Sequence of the Skin-Improving Lactobacillus curvatus Strain FBA2, Isolated from Fermented Vegetables, Determined by PacBio Single-Molecule Real-Time Technology, Genome Announcements, 4巻, 5号, 201610
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  21. Changes in spawning time led to the speciation of the broadcast spawning corals Acropora digitifera and the cryptic species Acropora sp. 1 with similar gamete recognition systems, Coral Reefs, 34巻, 4号, pp. 1189-1198, 201512
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  22. First complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa (Schroeter 1872) Migula 1900 (DSM 50071T), determined using PacBio single-molecule real-time technology, Genome Announcements, 3巻, 4号, 201508
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  23. Complete Genome Sequences of Low-Passage Virulent and High-Passage Avirulent Variants of Pathogenic Leptospira interrogans Serovar Manilae Strain UP-MMC-NIID, Originally Isolated from a Patient with Severe Leptospirosis, Determined Using PacBio Single-Molecule Real-Time Technology, Genome Announcements, 3巻, 4号, 201508
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  24. First complete genome sequences of Staphylococcus aureus subsp. aureus Rosenbach 1884 (DSM 20231T), determined by PacBio single-molecule real-time technology, Genome Announcements, 3巻, 4号, 201508
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  25. First complete genome sequence of Clostridium sporogenes DSM 795T, a nontoxigenic surrogate for Clostridium botulinum, determined using PacBio single-molecule real-time technology, Genome Announcements, 201508
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  26. Cryopreservation of Acropora digitifera sperm with use of sucrose and methanol based solution, Cryobiology, 69巻, 1号, 201408
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  27. Calcification responses of symbiotic and aposymbiotic corals to near-future levels of ocean acidification, Biogeosciences, 10巻, 11号, 2013
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  28. Symbiosis increases coral tolerance to ocean acidification, Biogeosciences Discussions, 10巻, 201304
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  29. Coral larvae under ocean acidification: survival, metabolism, and metamorphosis, PLoS One, 6巻, 1号, 201101
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク

招待講演、口頭・ポスター発表等

  1. 次世代シーケンスによるアナフィラキシー誘発性IgE抗体産生経路の可視化, 大木 駿, 河原 隆浩、河野 洋平、保田 朋波流, 第46回日本分子生物学会年会, 2023年12月06日, 通常, 日本語, 神戸国際会議場、神戸国際展示場、神戸ポートピアホテル
  2. ⼤規模なEBV遺伝⼦配列の⽐較解析による地域‧疾患関連変異の特定, 福島 ⼤誠, ⼤⽊ 駿、吉⾥ 倫、保⽥ 朋波流, 第46回日本分子生物学会年会, 2023年12月06日, 通常, 日本語, 神戸国際会議場、神戸国際展示場、神戸ポートピアホテル
  3. Epstein-Barrウイルス分⼦LMP1を⽤いた固形がん特異的細胞傷害性T細胞の誘導, ⼭根 慶⼤, 河野 洋平、⼤⽊ 駿、松岡 祐⾥、吉⾥ 倫、北嶋 康雄、塚原 涼⽕、福島 ⼤誠、保⽥ 朋波流, 第46回日本分子生物学会年会, 2023年12月06日, 通常, 日本語, 神戸国際会議場、神戸国際展示場、神戸ポートピアホテル
  4. 培養共通リンパ球系前駆細胞由来単球∕マクロファージ(cCLP-M)の性状及び機能解析, 河野 洋平, 森⼭ 瑞⽉、⼤⽊ 駿、北嶋 康雄、保⽥ 朋波流, 第46回日本分子生物学会年会, 2023年12月06日, 通常, 日本語, 神戸国際会議場、神戸国際展示場、神戸ポートピアホテル
  5. ゲノム縮約ライブラリーを対象にしたSNP検出におけるシーケンサー特異性の比較, 大木 駿, 北之坊 誠也、松本 悠貴、赤司 亜弥子、守田 昌哉、保田 朋波流, 第45回日本分子生物学会年会, 2022年12月01日, 通常, 日本語, 幕張メッセ
  6. 培養共通リンパ系前駆細胞由来ミエロイド系細胞(cCLP-M)の性状及び機能解析, 河野 洋平, 森山 瑞月, 大木 駿, 北嶋 康雄, 保田 朋波流,, 第45回日本分子生物学会年会, 2022年12月01日, 通常, 日本語, 幕張メッセ
  7. Plant Omics Databases: Plant Omics Data Center (PODC), CATchUP and TOMATOMICS, Toshiharu Endo, Misa Saito, Maasa Kanno, Shizuka Koshimizu, Kong Bihe, Shun Ohki, Eiji Nambara, Hajime Ohyanagi, Koh Aoki, Hiroshi Ezura, Kentaro Yano, International Plant & Animal Genome XXVIII, 2020年01月11日, 通常, 英語, San Diego, CA, USA
  8. イエネコにおける遺伝性疾患に関連する遺伝子変異と近傍の新規変異の探索, 大木 駿, 赤司 亜弥子、荒堀 みのり、鯉沼 恭子、石原 玄基、松本 悠貴, 日本畜産学会第128回大会, 2021年03月28日, 通常, 日本語, 九州大学
  9. イヌにおける遺伝性疾患に関連する遺伝子変異と近傍の新規変異の探索, 赤司 亜弥子, 大木 駿、荒堀 みのり、鯉沼 恭子、石原 玄基、松本 悠貴, 日本畜産学会第128回大会, 2021年03月28日, 通常, 日本語, 九州大学