船戸 耕一Kouichi Funato

Last Updated :2024/05/08

所属・職名
大学院統合生命科学研究科　准教授
ホームページ
https://gsbstop.hiroshima-u.ac.jp/kataru/ja/011.html
メールアドレス
kfunatohiroshima-u.ac.jp
自己紹介
《脂質動態と機能及び産業利用に関する研究》　真核生物の細胞内の構造は複雑であり、様々なオルガネラが存在します。このような膜で囲まれたオルガネラは特有の脂質とタンパク質から構成されており、その特徴が厳密に形成、維持されて、はじめて細胞は正常に機能します。私達のグループでは、生体膜を構成する脂質に焦点を当て、それらの脂質がどのように合成、輸送され維持されているのかを分子・遺伝子レベルで解明したいと考えています。また、脂質変動を細胞がどのように感知し、それによって細胞機能がどのように制御されているかについても明らかにしたいと考えています。これらの基礎研究を基盤として、発酵微生物である酵母を用いた新たなバイオテクノロジーへの応用、例えば医薬品や美容食品素材として利用できる脂質の大量生産システムの開発を目指しています。

基本情報

主な職歴

  • 2007年04月01日, 2019年03月31日, 広島大学, 大学院生物圏科学研究科, 准教授
  • 2004年03月01日, 2007年03月, 広島大学, 大学院生物圏科学研究科, 助教授
  • 2002年09月, 2004年02月, ジュネーブ大学, 理学部, 上級博士研究員
  • 1998年05月, 2002年08月, バーゼル大学, 生物研究所, 博士研究員
  • 1997年04月, 1998年03月, 理化学研究所, 基礎科学特別研究員
  • 1996年08月, 1997年01月, ワシントン大学医学部, 博士研究員
  • 1994年08月, 1996年07月, ワシントン大学医学部, 日本学術振興会海外特別研究員

学歴

  • 徳島大学, 薬学研究科, 薬品科学専攻, 日本, 1991年04月, 1994年03月
  • 徳島大学, 薬学部, 製薬化学科, 日本, 1985年04月, 1989年03月

学位

  • 博士（薬学）　(徳島大学)
  • 薬学修士　(徳島大学)

教育担当

  • 【学士課程】 生物生産学部 : 生物生産学科 : 分子農学生命科学プログラム
  • 【博士課程前期】 統合生命科学研究科 : 統合生命科学専攻 : 食品生命科学プログラム
  • 【博士課程後期】 統合生命科学研究科 : 統合生命科学専攻 : 食品生命科学プログラム

担当主専攻プログラム

  • 分子農学生命科学プログラム

研究分野

  • 農学 / 農芸化学 / 応用微生物学
  • 農学 / 農芸化学 / 応用生物化学

研究キーワード

  • 酵母
  • 脂質
  • 合成
  • 輸送
  • 機能

教育活動

授業担当

  1. 2024年, 教養教育, ３ターム, 細胞科学[1生]
  2. 2024年, 教養教育, ３ターム, 食の安心・安全と健康科学
  3. 2024年, 学部専門, 集中, 基礎化学実験
  4. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, 卒業論文I
  5. 2024年, 学部専門, セメスター（前期）, 卒業論文II
  6. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, 卒業論文III
  7. 2024年, 学部専門, 集中, 分子農学生命科学実験III
  8. 2024年, 学部専門, ４ターム, 分子細胞生物学
  9. 2024年, 学部専門, １ターム, 細胞工学
  10. 2024年, 学部専門, ４ターム, 生命物質分析学
  11. 2024年, 学部専門, ３ターム, 分子農学生命科学外書講読
  12. 2024年, 学部専門, 集中, (AIMS)Molecular Agro-life Science
  13. 2024年, 学部専門, ３ターム, Molecular Agro-life Science
  14. 2024年, 修士課程・博士課程前期, １ターム, 食品生命科学特別演習Ａ
  15. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ２ターム, 食品生命科学特別演習Ａ
  16. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ３ターム, 食品生命科学特別演習Ｂ
  17. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ４ターム, 食品生命科学特別演習Ｂ
  18. 2024年, 修士課程・博士課程前期, 年度, 食品生命科学特別研究
  19. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ２ターム, 応用分子細胞生物学Ⅰ
  20. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ４ターム, 応用分子細胞生物学Ⅱ
  21. 2024年, 博士課程・博士課程後期, 年度, 統合生命科学特別研究

研究活動

学術論文（★は代表的な論文）

  1. Ceramide sorting into non-vesicular transport is independent of acyl chain length in budding yeast, Biochemical and Biophysical Research Communications, 202404
  2. Protein sorting upon exit from the endoplasmic reticulum dominates Golgi biogenesis in budding yeast, FEBS Lett., 2024
  3. Membrane contact sites regulate vacuolar fission via sphingolipid metabolism, eLife, 2024
  4. Vacuole membrane contact sites regulate liquid-ordered domain formation during glucose starvation., FEBS Lett., 20230404
  5. GPIアンカー型タンパク質の選別輸送の品質管理, 生化学, 95巻, 2号, 20230425
  6. Quality-controlled ceramide-based GPI-anchored protein sorting into selective ER exit site, Cell Reports, 39巻, 5号, pp. 110768, 202205
  7. The Ceramide Synthase Subunit Lac1 Regulates Cell Growth and Size in Fission Yeast, Int. J. Mol. Sci., 23巻, 1号, pp. 303, 2022
  8. Membrane Contact Sites in Yeast: Control Hubs of Sphingolipid Homeostasis, Membranes, 11巻, pp. 971, 2021
  9. Protocol for measuring sphingolipid metabolism in budding yeast, STAR Protoc., 2021
  10. Structural analysis of the GPI glycan, PLOS ONE, 202109
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  11. Ceramide chain length-dependent protein sorting into selective endoplasmic reticulum exit sites., Sci. Adv., 2020
  12. Tricalbins are required for nonvesicular ceramide transport at ER-Golgi contacts and modulate lipid droplet biogenesis., iScience, 2020
  13. A defect in GPI synthesis as a suggested mechanism for the role of ARV1 in intellectual disability and seizures., Neurogenetics, 2020
  14. Cold-sensitive phenotypes of a yeast null mutant of ARV1 support its role as a GPI flippase., FEBS Lett., 2020
  15. Expression of two glutamate decarboxylase genes in Lactobacillus brevis during gamma-aminobutyric acid production with date residue extract., Biosci Biotechnol Biochem., 84巻, 5号, pp. 1069-1072, 2020
  16. Vesicular and non-vesicular lipid export from the ER to the secretory pathway., Biochim Biophys Acta Mol Cell Biol Lipids., 2020
  17. Sphingolipid/Pkh1/2-TORC1/Sch9 Signaling Regulates Ribosome Biogenesis in Tunicamycin-Induced Stress Response in Yeast., Genetics, 2019
  18. Lysophospholipids Facilitate COPII Vesicle Formation., Curr Biol., 28巻, 12号, pp. 1950-1958, 20180618
  19. Gamma-aminobutyric acid fermentation with date residue by a lactic acid bacterium, Lactobacillus brevis., J. Biosci. Bioeng., 125巻, 3号, pp. 316-319, 201803
  20. Protection mechanisms against aberrant metabolism of sphingolipids in budding yeast., Curr Genet., 64巻, 5号, pp. 1021-1028, 2018
  21. Protective role of the HOG pathway against the growth defect caused by impaired biosynthesis of complex sphingolipids in yeast Saccharomyces cerevisiae, Mol. Microbiol., 107巻, 3号, pp. 363-386, 201802
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  22. Arp2/3 complex and Mps3 are required for regulation of ribosome biosynthesis in the secretory stress response., Yeast, 34巻, 4号, pp. 155-163, 201704
  23. Complementation analysis reveals a potential role of human ARV1 in GPI anchor biosynthesis., Yeast, 33巻, pp. 37-42, 201602
  24. A lipid regulator working at the cleavage furrow, Cell Cycle, 15巻, 10号, pp. 1315-1316, 20160518
  25. Neuronal deficiency of ARV1 causes an autosomal recessive epileptic encephalopathy., Hum Mol Genet., 25巻, 14号, pp. 3042-3054, 20160715
  26. 脂質を動かす酵母Oshタンパク質ファミリー－オルガネラ膜接触部位におけるOshの役割－, 化学と生物, 53巻, 4号, pp. 212-214, 2015
  27. COPII Coat Composition Is Actively Regulated by Luminal Cargo Maturation, Curr. Biol., 25巻, 2号, pp. 152-162, 20150119
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  28. SMY2 and SYH1 suppress defects in ribosome biogenesis caused by ebp2 mutations, Biosci. Biotechnol. Biochem., 79巻, 9号, pp. 1481-1483, 20150902
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  29. Sphingolipids regulate telomere clustering by affecting the transcription of genes involved in telomere homeostasis, J. Cell Sci., 128巻, 14号, pp. 2454-2467, 20150715
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  30. The essential function of Rrs1 in ribosome biogenesis is conserved in budding and fission yeasts, Yeast, 32巻, 9号, pp. 607-614, 2015
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  31. Producing human ceramide-NS by metabolic engineering using yeast Saccharomyces cerevisiae, Sci. Rep., 5巻, 20151117
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  32. 細胞の生と死を調節する生体膜脂質, 化学と生物, 52巻, 2号, pp. 91-99, 201402
  33. Osh proteins regulate COPII-mediated vesicular transport of ceramide from the endoplasmic reticulum in budding yeast, J. Cell Sci., 127巻, 2号, pp. 376-387, 20140115
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  34. Metabolic labeling of yeast sphingolipids with radioactive D-erythro-[4,5-3H]dihydrosphingosine., Bio-Protocol (http://www.bio-protocol.org), 3巻, 16号, 201308
  35. Perturbation of sphingolipid metabolism induces endoplasmic reticulum stress-mediated mitochondrial apoptosis in budding yeast, Mol. Microbiol., 86巻, 5号, pp. 1246-1261, 2012
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  36. The yeast p24 complex regulates GPI-anchored protein transport and quality control by monitoring anchor remodeling, Mol. Biol. Cell, 22巻, 16号, pp. 2924-2936, 20110815
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  37. Functional Interactions between Sphingolipids and Sterols in Biological Membranes Regulating Cell Physiology, Mol. Biol. Cell, 20巻, 7号, pp. 2083-2095, 2009
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  38. Yeast ARV1 is required for efficient delivery of an early GPI intermediate to the first mannosyltransferase during GPI assembly and controls lipid flow from the endoplasmic reticulum., Mol. Biol. Cell, 19巻, pp. 2069-2082, 20080501
  39. Ethanol-induced death in yeast exhibits features of apoptosis mediated by mitochondrial fission pathway, FEBS Lett., 581巻, 16号, pp. 2935-2942, 20070626
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  40. Sphingoid base is required for translation initiation during heat stress in Saccharomyces cerevisiae, Mol. Biol. Cell, 17巻, 3号, pp. 1164-1175, 2006
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  41. Lcb4p is a key regulator of ceramide synthesis from exogenous long chain sphingoid base in Saccharomyces cerevisiae., J. Biol. Chem., 278巻, 9号, pp. 7325-7334, 20030228
  42. Biosynthesis and trafficking of sphingolipids in the yeast Saccharomyces cerevisiae., Biochemistry, 41巻, 51号, pp. 15105-15114, 20021224
  43. Sphingolipid biosynthesis and traffic in yeast., 生化学, 74巻, 4号, pp. 317-321, 20020401
  44. Sphingolipids are required for the stable membrane association of glycosylphosphatidylinositol-anchored proteins in yeast., J. Biol. Chem., 277巻, 51号, pp. 49538-49544, 20021220
  45. Vesicular and nonvesicular transport of ceramide from ER to the Golgi apparatus in yeast., J. Cell Biol., 155巻, 6号, pp. 949-959, 20011210
  46. Sphingoid base synthesis requirement for endocytosis in Saccharomyces cerevisiae., EMBO J., 19巻, 12号, pp. 2824-2833, 20000615
  47. A Salmonella virulence protein inhibits cellular trafficking., EMBO J., 18巻, 14号, pp. 3924-3933, 19990715
  48. A novel plasma factor initiating complement activation on cetylmannoside-modified liposomes in human plasma., Int J Pharm, 164巻, pp. 91-102, 1998
  49. Enhancing effect of cholesterol on the elimination of liposomes from circulation is mediated by complement activation., Int J Pharm, 156巻, pp. 27-37, 1997
  50. Sequential actions of Rab5 and Rab7 regulate endocytosis in the Xenopus Oocyte., J. Cell Biol., 136巻, 6号, pp. 1227-1237, 19970324
  51. Rab7 regulates transport from early to late endocytic compartments in Xenopus Oocytes., J. Biol. Chem., 272巻, 20号, pp. 13055-13059, 19970516
  52. Reconstitution of phagosome-lysosome fusion in streptolysin O-permeabilized cells., J. Biol. Chem., 272巻, 26号, pp. 16147-16151, 19970627
  53. Biopharmaceutical evaluation of the liposomes prepared by rehydration of freeze-dried empty liposomes (FDELs) with an aqueous solution of a drug., Biopharm Drug Dispos., 17巻, 7号, pp. 589-605, 199610
  54. The complement- but not mannose receptor-mediated phagocytosis is involved in the hepatic uptake of cetylmannoside-modified liposomes in situ., J Drug Target, 2巻, pp. 141-146, 1994
  55. Plasma factor triggering alternative complement pathway activation by liposomes., Pharm Res., 11巻, pp. 372-376, 199403
  56. Enhanced hepatic uptake of liposomes through complement activation depending on the size of liposomes., Pharm Res., 11巻, 3号, pp. 402-406, 199403
  57. Contribution of complement system on destabilization of liposomes composed of hydrogenated egg phosphatidylcholine in rat fresh plasma., Biochem. Biophys. Acta, 1103巻, pp. 198-204, 199201
  58. Effect of species differences on complement activation by cetylmannoside-modified liposomes in fresh plasma., Drug Delivery System, 7巻, pp. 165-168, 1992

著書等出版物

  1. 2022年11月10日, つくると食べるをつなぐサイエンス, 5-2. 酵母工場, 2022年, 11, J
  2. 2006年, Sphingolipid Biology, [Sphingolipid Trafficking] pp.123-139, Springer-Verlag Tokyo, 2006年, 0, 単行本（学術書）, 共著, 4431341986, 531
  3. 2011年, 生命・食・環境のサイエンス, 細胞の姿, 共立出版, 2011年, 11, 共著, 4
  4. 2018年, 酵母菌・麹菌・乳酸菌の産業応用展開, シーエムシー出版, 2018年, 1月, 共著, J
  5. 2021年11月30日, SDGsに向けた生物生産学入門, 1.1 生物の基本単位ー細胞とは, 共立出版, 2021年, 11, 共編著, J

外部資金

競争的資金等の採択状況

  1. 科学研究費助成事業(挑戦的研究(萌芽)), 脂質代謝を起点とした転写による小胞輸送制御機構の解明, 2021年, 2023年
  2. 科学研究費助成事業(基盤研究(B)), 糖脂質リモデリングによる蛋白質のソーティング機構, 2019年, 2022年
  3. 科学研究費助成事業(基盤研究(C)), スフィンゴ脂質によるTORキナーゼ複合体1の新規制御機構の解明, 2016年, 2018年
  4. 科学研究費助成事業(基盤研究(C)), 小胞輸送からリボソーム生合成へのシグナル伝達における細胞骨格形成の関与, 2013年, 2015年
  5. 科学研究費助成事業(基盤研究(C)), 小胞輸送からリボソーム生合成へのシグナル伝達における細胞骨格形成の関与, 2013年, 2015年
    関連URL
  6. 科学研究費助成事業(基盤研究(C)), リボソーム生合成と小胞輸送の連携, 2010年, 2012年
    関連URL
  7. 科学研究費助成事業(基盤研究(C)), GPIフリッパーゼとGPI生合成の生理的意義の解析, 2009年, 2011年
    関連URL
  8. 科学研究費助成事業(基盤研究(C)), アポトーシスに触発されるエンドサイトーシス系の膜輸送と脂質恒常性の機序, 2007年, 2008年
    関連URL