西村 慎一SHINICHI NISHIMURA

Last Updated :2024/07/03

所属・職名
大学院統合生命科学研究科　教授
ホームページ
https://mbrc.hiroshima-u.ac.jp/
メールアドレス
nshinhiroshima-u.ac.jp
自己紹介
微生物や海洋動物、植物からは様々な化学構造を有する生物活性化合物（天然物）が報告されてきました．天然物の化学構造は合成化合物とは異なる化学的なプロパティを有しており、時として思いがけない生物活性を示します．そしていくつかの天然物は医薬品や農薬として活用され、あるいは生命現象を解き明かすツールとして利用されています． 　人類はこのような天然物を十分に活用してきたでしょうか？答えはNoだと私たちは考えています．これまでに50万を超える化合物が報告されているそうですが、その一部しか活用されていません．その大きな原因の一つは、化合物の生物活性が不明であることにあります．一方でユニークな生物活性を示す化合物は何のために産生されているのでしょうか？ほとんどの場合にそれらの生理活性は不明です．アオカビからペニシリンが発見されて一世紀が経とうとしていますが天然物化学の分野には多くの未解明現象が残されているのです。 　私たちはこのような課題や疑問に答えるべく、ユニークな生命現象に着目して微生物や海洋生物から生物活性化合物を探索し、生物活性と生理活性の発現メカニズムの解明研究を進めています．

基本情報

主な職歴

  • 2023年01月, 広島大学, 大学院統合生命科学研究科, 教授
  • 2018年03月, 2022年12月, 東京大学, 大学院 農学生命科学研究科, 講師
  • 2016年08月, 2017年08月, スクリプス海洋研究所, 訪問研究員
  • 2009年04月, 2018年02月, 京都大学, 大学院 薬学研究科, 助教
  • 2007年10月, 2009年03月, 京都大学, 大学院 薬学研究科, 産学官連携研究員
  • 2004年10月, 2007年09月, 理化学研究所吉田化学遺伝学研究室, 基礎科学特別研究員
  • 2004年04月, 2004年09月, 理化学研究所吉田化学遺伝学研究室, 協力研究員

学歴

  • 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 水圏生物科学専攻博士課程, 日本, 2001年04月, 2004年03月
  • 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 水圏生物科学専攻修士課程, 日本, 1999年04月, 2001年03月
  • 東京大学, 農学部, 水圏生物科学専修, 日本, 1995年04月, 1999年03月

学位

  • 修士（農学）　(東京大学)
  • 博士（農学）　(東京大学)

研究分野

  • 農学 / 農芸化学 / 生物有機化学

研究キーワード

  • 天然物化学、ケミカルバイオロジー、微生物学

所属学会

教育活動

授業担当

  1. 2024年, 教養教育, ３ターム, 有機化学[1生]
  2. 2024年, 学部専門, ４ターム, 食品生命科学リサーチフロント
  3. 2024年, 学部専門, ４ターム, 水産食品化学
  4. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, 卒業論文I
  5. 2024年, 学部専門, セメスター（前期）, 卒業論文II
  6. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, 卒業論文III
  7. 2024年, 学部専門, ２ターム, 食品科学外書講読
  8. 2024年, 学部専門, 集中, 海洋生物資源化学実験
  9. 2024年, 学部専門, 集中, 水産食品製造学実験実習
  10. 2024年, 学部専門, セメスター（前期）, Graduate Thesis I
  11. 2024年, 学部専門, セメスター（後期）, Graduate Thesis II
  12. 2024年, 学部専門, 集中, (AIMS) Modern Food Science
  13. 2024年, 学部専門, ３ターム, Modern Food Science
  14. 2024年, 修士課程・博士課程前期, １ターム, 食品生命科学特別演習Ａ
  15. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ２ターム, 食品生命科学特別演習Ａ
  16. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ２ターム, 生理活性天然物化学Ⅰ
  17. 2024年, 修士課程・博士課程前期, ４ターム, 生理活性天然物化学Ⅱ

研究活動

学術論文（★は代表的な論文）

  1. Protocol for detecting threonine deaminase activity in fission yeast cell lysates, STAR PROTOCOLS, 4巻, 4号, 20231215
    DOIを用いた論文検索結果へのリンク
  2. A set of vectors and strains for chromosomal integration in fission yeast, Sci Rep, 13巻, 1号, pp. 9295, 20230608
  3. FK506-binding protein, FKBP12, promotes serine utilization and negatively regulates threonine deaminase in fission yeast., iScience, 25巻, 12号, pp. 105659, 20221124
  4. Ferrichrome, a fungal-type siderophore, confers high ammonium tolerance to fission yeast., Sci Rep, 12巻, 1号, pp. 17411, 20221027
  5. Genome-based discovery and total synthesis of janustatins, potent cytotoxins from a plant-associated bacterium., Nat Chem, 14巻, 10号, pp. 1193-1201, 202210
  6. Differential Biosynthesis and Roles of Two Ferrichrome-Type Siderophores, ASP2397/AS2488053 and Ferricrocin, in Acremonium persicinum., ACS Chem Biol, 17巻, 1号, pp. 207-216, 20220121

招待講演、口頭・ポスター発表等

  1. グルタチオンは分裂酵母の細胞形態を制御する細胞間コミュニケーション分子である．, 〇吉住僚太朗、三浦俊一、松山晃久、八代田陽子、吉田稔、西村慎一．, 日本ケミカルバイオロジー学会 第18会年会, 2024年05月
  2. 分裂酵母Schizosaccharomyces pombeにおいてペンタデカン酸が誘導する脂肪毒性, 〇星川陽次郎、代田夏帆、松山晃久、木村聡、Sheena Li、八代田陽子、Charles Boone、津川裕司、有田誠、吉田稔、西村慎一, 日本農芸化学会 2024年度東京大会, 2024年03月
  3. グルタチオンは分裂酵母の栄養制御に関わる細胞間コミュニケーション分子である, 〇吉住僚太朗、三浦俊一、松山晃久、八代田陽子、吉田稔、西村慎一, 日本農芸化学会 2024年度東京大会, 2024年03月
  4. 分裂酵母のロバストな増殖を支える共生物質の探索と機能解析, 日本農芸化学会2024年度大会 シンポジウム「抗生か、共生か？微生物コミュニティを制御する情報分子としての天然物」, 2024年03月
  5. Omics analyses of the cell membrane using marine natural products, 〇Nishimura, S., Gordon Research Conference -Marine Natural Products-, 2024年03月, 招待
  6. Lipotoxicity induced by pentadecanoic acid in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe., 〇Hoshikawa, Y., Shirota, N., Matsuyama, A., Kimura, S., Li, S., Yashiroda, Y., Boone, C., Tsugawa, H., Arita, M., Yoshida, M., Nishimura, S., Gordon Research Conference -Marine Natural Products-, 2024年03月
  7. Genome-wide screen for discovering cell-cell communication molecules in fission yeast., 〇Yoshizumi, R., Miura, S., Matsuyama, A., Yashiroda, Y., Yoshida, M., & Nishimura, S., 日本微生物生態学会 第36回浜松大会/アジア微生物生態シンポジウム 第13回浜松大会, 2023年11月
  8. 分裂酵母の細胞間コミュニケーション分子の組織的探索．, 〇西村慎一., 第23回真核微生物交流会, 2023年09月, 招待
  9. 分裂酵母の細胞間コミュニケーションにおけるグルタチオンの生理機能解析, 〇吉住僚太朗、三浦俊⼀、松⼭晃久、⼋代⽥陽⼦、吉⽥稔、⻄村慎⼀．, 酵⺟遺伝学フォーラム 第56回 研究報告会, 2023年08月
  10. ASP2397 and synthetic analogues induce abnormal acceleration of retrograde pathway in the endosome., 〇Hiratsuka, T., Hashizume, Y., Chibana, H., Umeyama, T., Nishimura, S., & Yoshida, M., The 11th International Fission Yeast Meeting (Pombe2023), 2023年05月
  11. Exogenous pentadecanoic acid perturbs the membrane lipid profile to generate the giant endoplasmic reticulum sheet., 〇Hoshikawa, Y., Matsuyama, A., Li, S., Yashiroda, Y., Boone, C., Tsugawa, H., Arita, M., Yoshida, M., & Nishimura, S., The 11th International Fission Yeast Meeting (Pombe2023), 2023年05月
  12. Activation of Cdc42 and accumulation of Bgs proteins at growing tips by theonellamides, marine-derived antifungals., 〇Nishimura, S., Nakao, K., Suganaga, A., Hiratsuka, T., Yashiroda, Y., Matsuyama, A., & Yoshida, M., The 11th International Fission Yeast Meeting (Pombe2023), 2023年05月
  13. Genome-wide screen identifies glutathione as a putative communication molecule in Schizosaccharomyces pombe., 〇Yoshizumi, R., Miura, S., Matsuyama, A., Yashiroda, Y., Yoshida, M., & Nishimura, S., The 11th International Fission Yeast Meeting (Pombe2023), 2023年05月
  14. How do S. pombe cells produce and perceive the cell-cell communication molecules Nitrogen Signaling Factors (NSFs)?, 〇Yashiroda, Y., Li, H., Hirai, G., Usui, M., Ohsawa, S., Nishimura, S., & Yoshida, M., The 11th International Fission Yeast Meeting (Pombe2023), 2023年05月

外部資金

競争的資金等の採択状況

  1. 科学研究費助成事業（科研費）挑戦的研究(萌芽), 揮発性コミュニケーション分子による異種微生物間相互作用の分子基盤解明, 2023年, 2024年
  2. 科学研究費助成事業（科研費）基盤研究（S）（分担）, 化学遺伝学と情報科学による内在性代謝物の隠された機能の解明, 2023年, 2027年
  3. 科学研究費助成事業（科研費）基盤研究（B）, マルチターゲットを有する膜脂質の化学オミクス解析, 2021年, 2023年
  4. 科学研究費助成事業（科研費）挑戦的研究（萌芽）, セリン代謝の化学遺伝学的解析, 2021年, 2022年
  5. 科学研究費助成事業（科研費）基盤研究（S）（分担）, 革新的化学遺伝学による内在性代謝物の新機能の解明と応用, 2019年, 2023年