斉藤 稔NEN SAITO

Last Updated :2024/02/01

所属・職名
広島大学 准教授
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メールアドレス
nensaitohiroshima-u.ac.jp
自己紹介
生物物理学/理論生物学/数理モデリング

基本情報

学位

  • 修士(理学) (大阪大学)
  • 博士(理学) (大阪大学)

研究キーワード

  • 複雑系
  • 数理生物学
  • 生物物理

教育活動

授業担当

  1. 2023年, 学部専門, 3ターム, 情報数理概説
  2. 2023年, 学部専門, 2ターム, 複雑系数理
  3. 2023年, 学部専門, セメスター(前期), 数学情報課題研究
  4. 2023年, 学部専門, セメスター(後期), 数学情報課題研究
  5. 2023年, 学部専門, 3ターム, 数学特別講義(離散構造上の力学系と幾何学への入門とその応用:化学反応系から情報学まで)
  6. 2023年, 修士課程・博士課程前期, 年度, 数理生命科学特別研究
  7. 2023年, 修士課程・博士課程前期, 3ターム, 数理モデリングA
  8. 2023年, 修士課程・博士課程前期, 3ターム, 数理生命科学特別講義B
  9. 2023年, 修士課程・博士課程前期, セメスター(前期), 数理計算理学特別演習A
  10. 2023年, 修士課程・博士課程前期, セメスター(後期), 数理計算理学特別演習B
  11. 2023年, 博士課程・博士課程後期, 3ターム, 数理生命科学特別講義F
  12. 2023年, 修士課程・博士課程前期, 1ターム, 先端生命技術概論

研究活動

学術論文(★は代表的な論文)

  1. Emergence of Bow-tie Architecture in Evolving Feedforward Networks, bioRxiv, 202303
  2. ★, Active Deformable Cells Undergo Cell Shape Transition Associated with Percolation of Topological Defects, arXiv, 202303
  3. Rare-event sampling analysis uncovers the fitness landscape of the genetic code, PLOS Computational Biology, 19巻, 4号, pp. e1011034, 202304
  4. A method for morphological feature extraction based on variational auto-encoder : an application to mandible shape, bioRxiv, 20220519
  5. Intercellular exchange of Wnt ligands reduces cell population heterogeneity in embryogenesis, Nature Communications, 14巻, 202304
  6. Microtopographical guidance of macropinocytic signaling patches, Proceedings of the National Academy of Sciences, 118巻, 50号, 20211214
  7. ★, Three-dimensional morphodynamic simulations of macropinocytic cups, iScience, 24巻, 10号, pp. 103087-103087, 202110
  8. Comparative mapping of crawling-cell morphodynamics in deep learning-based feature space, PLOS Computational Biology, 17巻, 8号, pp. e1009237-e1009237, 20210812
  9. Adaptation of metabolite leakiness leads to symbiotic chemical exchange and to a resilient microbial ecosystem, PLOS Computational Biology, 17巻, 6号, 20210623
  10. Advantage of Leakage of Essential Metabolites for Cells, Physical Review Letters, 124巻, 4号, 20200128
  11. Embedding dual function into molecular motors through collective motion, SCIENTIFIC REPORTS, 7巻, 201703
  12. Symbiotic Cell Differentiation and Cooperative Growth in Multicellular Aggregates, PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12巻, 10号, 201610
  13. Motif analysis for small-number effects in chemical reaction dynamics, JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 145巻, 9号, 201609
  14. Theoretical analysis of discreteness-induced transition in autocatalytic reaction dynamics, PHYSICAL REVIEW E, 91巻, 2号, 201502
  15. Multicanonical MCMC for sampling rare events: an illustrative review, ANNALS OF THE INSTITUTE OF STATISTICAL MATHEMATICS, 66巻, 3号, pp. 611-645, 201406
  16. Evolution of genetic redundancy: the relevance of complexity in genotype-phenotype mapping, NEW JOURNAL OF PHYSICS, 16巻, 201406
  17. Baldwin effect under multipeaked fitness landscapes: Phenotypic fluctuation accelerates evolutionary rate, PHYSICAL REVIEW E, 87巻, 5号, 20130502
  18. Robustness leads close to the edge of chaos in coupled map networks: toward the understanding of biological networks, NEW JOURNAL OF PHYSICS, 15巻, 201305
  19. Probability of graphs with large spectral gap by multicanonical Monte Carlo, COMPUTER PHYSICS COMMUNICATIONS, 182巻, 1号, pp. 223-225, 201101
  20. Multicanonical sampling of rare events in random matrices, PHYSICAL REVIEW E, 82巻, 3号, 201009

外部資金

競争的資金等の採択状況

  1. 学術変革領域研究(A) 公募研究, トポロジカル欠陥に駆動される3D形態形成解明のための数理研究, 2023年, 2025年
  2. 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 変形可能なアクティブマターにおける集団的秩序形成の数理的研究, 2021年04月01日, 2024年03月31日
  3. 科学研究費助成事業 学術変革領域研究(A) 公募研究, 組織スケールの細胞骨格配向が形造る3D形態形成解明のための理論研究, 2021年09月, 2023年03月
  4. 科学研究費助成事業 若手研究, 場の3D大変形と反応拡散が織りなす新奇の自己組織化現象:マクロ飲作用を題材として, 2018年04月, 2021年03月
  5. 科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)), 少数性転移を起こすコア反応モチーフの解析とその探索, 2014年04月, 2016年03月