呉 佳齊JIAQI WU

Last Updated :2025/06/04

所属・職名
大学院統合生命科学研究科 助教
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メールアドレス
wujiaqi06gmail.com
自己紹介
私の研究は、進化生物学および統計遺伝学を基盤とし、生物ゲノムのビッグデータを活用して、複雑な生物形質の背後にある遺伝的メカニズムを解明することを目的としています。主に哺乳類および鳥類を対象とし、複雑形質に関わるゲノム変異の統計的モデリング、生物学的形質の進化過程の推定、未知ゲノムからの生物学的特性の予測、さらにその成果の遺伝子育種や医療への応用に取り組んでいます。加えて、ウイルスの進化史の解析や、ウイルス変異の頻度解析、高リスク変異のモニタリング、ウイルス制御に資する情報提供など、ウイルス学的研究も並行して行っています。

基本情報

主な職歴

  • 2025年04月01日, 広島大学生物生産学部, 助教
  • 2024年04月01日, 2025年03月31日, 広島大学生物生産学部, CAP研究員
  • 2023年05月01日, 2023年06月30日, 広島大学生物生産学部, 研究員
  • 2021年04月01日, 2023年03月31日, 国立研究開発法人 科学技術振興機構 (JST), CREST研究員
  • 2021年04月01日, 2023年03月31日, 東海大学医学部, 特定研究員
  • 2018年09月01日, 2021年03月31日, 日本学術振興会・東京科学大学(旧東京工業大学)生命理工学院, JSPS特別研究員(PD)
  • 2014年06月01日, 2014年08月30日, 東京科学大学(旧東京工業大学)生命理工学院, 研究員
  • 2018年04月01日, 2018年08月31日, (財)進化生物学研究所, 客員研究員(上席・主任研究員クラス)
  • 2014年10月04日, 2015年03月31日, 東京大学大学院農学生命科学研究科, 研究生
  • 2009年07月01日, 2010年06月30日, 復旦大学(中国)生物医学研究院及び上海市公共衛生臨床センター, ラボテクニシャン

学歴

  • 東京大学, 農学生命科学研究科, 生産・環境生物学専攻 統計遺伝学博士課程, 日本, 2015年04月01日, 2018年03月22日
  • 東北師範大学, 中国赴日本国留学予備学校, 日本語専攻, 中国, 2013年09月01日, 2014年10月01日
  • 復旦大学, 生命科学学院, 進化・生態学専攻 生物情報科学修士課程, 中国, 2009年09月01日, 2013年06月30日
  • 山東大学, 医学部, 公共健康医学専攻 予防医学, 中国, 2004年09月01日, 2009年07月01日

学位

  • 学士(医学) (山東大学)
  • 修士(理学) (復旦大学)
  • 博士(農学) (東京大学)

研究分野

  • 医歯薬学 / 基礎医学 / ウイルス学
  • 農学 / 生産環境農学 / 遺伝育種科学
  • 生物学 / 基礎生物学 / 進化生物学
  • 総合生物 / ゲノム科学 / ゲノム生物学

教育活動

授業担当

  1. 2025年, 学部専門, 集中, International Applied Biological Sciences I
  2. 2025年, 学部専門, 集中, (AIMS) Introduction Physiology of Domestic Animals
  3. 2025年, 学部専門, 集中, Introductory Physiology of Domestic Animals

研究活動

学術論文(★は代表的な論文)

  1. High altitude adaptation of the schizothoracine fishes (Cyprinidae) revealed by the mitochondrial genome analyses, Gene, 517巻, 2号, pp. 169-178, 2013
  2. ★, Importance of synonymous substitutions under dense taxon sampling and appropriate modeling in reconstructing the mitogenomic tree of Eutheria, Genes & genetic systems, 89巻, 5号, pp. 237-251, 2014
  3. ★, Phylogeographic and Demographic Analysis of the Asian Black Bear (Ursus thibetanus) Based on Mitochondrial DNA, PLoS One, 10巻, 9号, pp. e0136398, 2015
  4. Phylogenomics and morphology of extinct paleognaths reveal the origin and evolution of the ratites, Current Biology, 28巻, 7号, pp. 68-77, 2017
  5. Computational Identification of Amino-Acid Mutations that Further Improve the Activity of a Chalcone–Flavonone Isomerase from Glycine max, Frontiers in Plant Science, 8巻, pp. 248, 2017
  6. Expression map of a complete set of gustatory receptor genes in chemosensory organs of Bombyx mori, Insect Biochemistry and Molecular Biology, 82巻, pp. 74-82, 2017
  7. ★, Rates of molecular evolution suggest natural history of life history traits and a post-K-Pg nocturnal bottleneck of placentals, Current Biology, 27巻, 19号, pp. 3025-3033. e5, 2017
  8. ★, Genomic adaptation to polyphagy and insecticides in a major East Asian noctuid pest, Nature ecology & evolution, 1巻, 11号, pp. 1747-1756, 2017
  9. A single pheromone receptor gene conserved across 400 My of vertebrate evolution, Molecular Biology and Evolution, 35巻, 12号, pp. 2928-2939, 2018
  10. Comparative genomic analyses illuminate the distinct evolution of megabats within Chiroptera, DNA Research, 27巻, 4号, pp. dsaa021, 2020
  11. ★, Evolution of reproductive life history in mammals and the associated change of functional constraints, Genes, 12巻, 5号, pp. 740, 2021
  12. SARS-CoV-2 spike L452R variant evades cellular immunity and increases infectivity, Cell host & microbe, 29巻, 7号, pp. 1124-1136. e11, 2021
  13. ★, World-wide prevalence of substitutions in HCV genome associated with resistance to direct-acting antiviral agents, Clinical Gastroenterology and Hepatology, 19巻, 9号, pp. 1906-1914. e25, 2021
  14. SARS-CoV-2 B.1.617.2 Delta variant replication and immune evasion, Nature, 599巻, 7883号, pp. 114-119, 2021
  15. ★, The SARS-CoV-2 Lambda variant exhibits enhanced infectivity and immune resistance, Cell reports, 38巻, 2号, 2022
  16. Enhanced fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Delta P681R mutation, Nature, 602巻, 7896号, pp. 300-306, 2022
  17. Altered TMPRSS2 usage by SARS-CoV-2 Omicron impacts infectivity and fusogenicity, Nature, 603巻, 7902号, pp. 706-714, 2022
  18. ★, Molecular Evolutionary Rate Predicts Intraspecific Genetic Polymorphism and Species-Specific Selection, Genes, 13巻, 4号, pp. 708, 2022
  19. Paleogenomics reveals independent and hybrid origins of two morphologically distinct wolf lineages endemic to Japan, Current Biology, 32巻, 11号, pp. 2494-2504. e5, 2022
  20. ★, Massive loss of transcription factors promotes the initial diversification of placental mammals, International Journal of Molecular Sciences, 23巻, 17号, pp. 9720, 2022
  21. Characterization of the immune resistance of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 mu variant and the robust immunity induced by mu infection, The Journal of Infectious Diseases, 226巻, 7号, pp. 1200-1203, 2022
  22. Monitoring fusion kinetics of viral and target cell membranes in living cells using a SARS-CoV-2 spike-protein-mediated membrane fusion assay, STAR protocols, 3巻, 4号, pp. 101773, 2022
  23. ★, The SARS-CoV-2 spike S375F mutation characterizes the Omicron BA.1 variant, Iscience, 25巻, 12号, 2022
  24. Convergent evolution of SARS-CoV-2 Omicron subvariants leading to the emergence of BQ. 1.1 variant, Nature Communications, 14巻, 1号, pp. 2671, 2023
  25. Virological characteristics of the SARS-CoV-2 XBB variant derived from recombination of two Omicron subvariants, Nature communications, 14巻, 1号, pp. 2800, 2023
  26. Comparative pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron subvariants including BA. 1, BA. 2, and BA. 5, Communications Biology, 6巻, 1号, pp. 1-12, 2023
  27. SARS-CoV-2 HaploGraph: visualization of SARS-CoV-2 haplotype spread in Japan, Genes & Genetic Systems, 98巻, 5号, pp. 221-237, 2023
  28. ★, Multiple mutations of SARS-CoV-2 Omicron BA. 2 variant orchestrate its virological characteristics, Journal of virology, 97巻, 10号, pp. e01011-23, 2024
  29. Origin and spatial population structure of Malagasy native chickens based on mitochondrial DNA, Scientific Reports, 14巻, 1号, pp. 569, 2024
  30. Genes involved in the limited spread of SARS-CoV-2 in the lower respiratory airways of hamsters may be associated with adaptive evolution, Journal of Virology, 98巻, 5号, pp. e01784-23, 2024
  31. Conserved genetic background but geographically differentiated DNA methylation patterns in invasive alligator weed (Alternanthera philoxeroides) populations of China and Japan, Biological Invasions, 26巻, 7号, pp. 2351-2365, 2024
  32. ★, SGV-caller: SARS-CoV-2 genome variation caller, Heliyon, 11巻, 4号, pp. e42613, 2025
  33. ★, Evolutionary analysis and population dynamics in the global transmission of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus, ARCHIVES OF VIROLOGY, 170巻, 5号, 2025

著書等出版物

  1. 2025年04月, 科学方法論としての統計技法, 第8章:統計的モデリング, 勁草書房, 単行本(学術書), 共著, 日本語, 呉佳齊、米澤隆弘、岸野洋久
  2. 2022年01月26日, 遺伝学の百科事典 13-9, 哺乳類の進化と多様性, 丸善出版, 事典・辞書, 共著, 日本語, 呉佳齊、米澤隆弘

受賞

  1. 2012年12月13日, 国家奖学金, 中華人民共和国教育部
  2. 2013年01月09日, 陸宗霖奨学金, 復旦大学
  3. 2018年03月22日, 研究科長賞, 東京大学農学生命科学研究科