下村 拓史TAKUSHI SHIMOMURA

Last Updated :2026/09/02

所属・職名
大学院医系科学研究科（医）　講師
メールアドレス
shimothiroshima-u.ac.jp

基本情報

主な職歴

  • 2026年03月01日, 広島大学, 大学院医系科学研究科・生理学及び生物物理学教室, 講師
  • 2015年04月, 2026年02月, 生理学研究所, 分子細胞生理研究領域 神経機能素子研究部門, 助教
  • 2012年04月, 2015年03月, 名古屋大学, 細胞生理学研究センター, 特定研究員
  • 2011年04月, 2012年03月, 京都大学, 特定研究員

学歴

  • 京都大学, 大学院理学研究科, 生物科学専攻 博士後期課程, 2008年04月, 2011年03月
  • 京都大学, 大学院理学研究科, 生物科学専攻 博士前期課程, 2006年04月, 2008年03月
  • 京都大学, 理学部, 2002年04月, 2006年03月

学位

  • 修士（理学）　(京都大学)
  • 博士（理学）　(京都大学)
  • 博士（理学）　(京都大学)

研究キーワード

  • ナトリウムチャネル
  • 電位依存性
  • two-pore channel
  • 電気生理学
  • イオンチャネル

教育活動

授業担当

  1. 2026年, 学部専門, 通年, 組織細胞機能学
  2. 2026年, 博士課程・博士課程後期, １ターム, 研究方法論B

研究活動

学術論文（★は代表的な論文）

  1. ★, Extracellular K+ modulates the pore conformations of Cys-loop receptor anion channels., Nature communications, 17巻, 1号, 2026
  2. Characterization and Engineering of a Blue-Sensitive, Gi/o-Biased, and Bistable Ciliary Opsin from a Fan Worm., Biochemistry, 64巻, 5号, 2025
  3. Descending to inhibit: Antagonist-induced downward shift of VSD II in TPC2., Structure (London, England : 1993), 32巻, 8号, 2024
  4. ★, Conformational rearrangements in the second voltage sensor domain switch PIP2- and voltage-gating modes in two-pore channels., Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 120巻, 6号, 2023
  5. Closed-state inactivation of cardiac, skeletal, and neuronal sodium channels is isoform specific., The Journal of general physiology, 154巻, 7号, 2022
  6. Dopamine drives neuronal excitability via KCNQ channel phosphorylation for reward behavior., Cell reports, 40巻, 10号, 2022
  7. Mechanism of hERG inhibition by gating-modifier toxin, APETx1, deduced by functional characterization., BMC molecular and cell biology, 22巻, 1号, 2021
  8. Phosphoinositide regulates dynamic movement of the S4 voltage sensor in the second repeat in two-pore channel 3., The Journal of biological chemistry, 297巻, 6号, 2021
  9. A native prokaryotic voltage-dependent calcium channel with a novel selectivity filter sequence., eLife, 9巻, 2020
  10. Phosphoinositides modulate the voltage dependence of two-pore channel 3., The Journal of general physiology, 151巻, 8号, 2019
  11. SLO potassium channels antagonize premature decision making in C. elegans, COMMUNICATIONS BIOLOGY, 1巻, pp. 123-123, 2018
  12. Optimized expression and purification of NavAb provide the structural insight into the voltage dependence., FEBS letters, 592巻, 2号, 2018
  13. Two mutations at different positions in the CNBH domain of the hERG channel accelerate deactivation and impair the interaction with the EAG domain., The Journal of physiology, 596巻, 19号, 2018
  14. SLO potassium channels antagonize premature decision making in C. elegans., Communications biology, 1巻, 2018
  15. Control of Spontaneous Ca2+ Transients Is Critical for Neuronal Maturation in the Developing Neocortex., Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991), 26巻, 1号, 2016
  16. Molecular determinants of prokaryotic voltage-gated sodium channels for recognition of local anesthetics., The FEBS journal, 283巻, 15号, 2016
  17. Two alternative conformations of a voltage-gated sodium channel., Journal of molecular biology, 425巻, 22号, 2013
  18. The C-terminal helical bundle of the tetrameric prokaryotic sodium channel accelerates the inactivation rate., Nature communications, 3巻, 2012
  19. Arrangement and mobility of the voltage sensor domain in prokaryotic voltage-gated sodium channels., The Journal of biological chemistry, 286巻, 9号, 2011
  20. Comparative study of the gating motif and C-type inactivation in prokaryotic voltage-gated sodium channels., The Journal of biological chemistry, 285巻, 6号, 2010
  21. Evidence for lateral mobility of voltage sensors in prokaryotic voltage-gated sodium channels., Biochemical and biophysical research communications, 399巻, 3号, 2010

著書等出版物

  1. 2018年04月04日, 脳神経化学: 脳はいま化学の言葉でどこまで語れるか (DOJIN BIOSCIENCE SERIES), 化学同人, 分担執筆, jpn, 森, 泰生; 尾藤, 晴彦, 4759817263, 4759817263, 356

招待講演、口頭・ポスター発表等

  1. Extracellular K+ dependence of the Cys-loop receptor anion channels, The 55th NIPS International Symposium
  2. A switching role of the 2nd S4 helix in the voltage- and PIP2-dependence of Two-Pore channels revealed by voltage clamp fluorometry, Endolysosomal Ion Channels & Diseases 2025, 2025年10月25日
  3. A distinct role of the 2nd voltage-sensor domain in Two-pore channels revealed by voltage clamp fluorometry, Takushi Shimomura, Yonsei University – Korea University – NIPS joint symposium, 2024年11月21日
  4. 非天然アミノ酸導入によるイオンチャネルの光感受化, 下村 拓史, 生理研研究会「生理機能の理解に向けた膜タンパク質機能ダイナミクス研究の最前線と未来開拓」, 2024年09月03日
  5. A switching mechanism between PIP2-and voltage-dependence in two-pore channels, Takushi Shimomura, 第101回日本生理学会大会, 2024年03月29日
  6. Voltage clamp fluorometry of two-pore channels reveals a unique movement of 2nd S4 helix, Takushi Shimomura, IINS Bordeaux – NIPS joint symposium “Shedding Light on the Brain with Advanced Neurotechnology and Biophotonics”, 2024年02月04日
  7. Contribution of the 2nd S4 helix for switching PIP2- and voltage-gating modes in two-pore channels, Takushi Shimomura, Ion Channel Modulation Symposium 2023, 2023年05月17日
  8. 膜電位下蛍光電流同時測定法により明らかになった、Two-pore Channelにおけるリガンド依存性と電位依存性ゲーティングの切り替え・統合の分子基盤, 下村 拓史, 第95回⽇本⽣化学会⼤会, 2022年11月09日
  9. Two-pore channelのゲーティングにおけるPIP2結合および電位感受性の寄与は リピート 2のS4ヘリックスの状態に依存する, 下村 拓史, 生理研研究会「構造情報を基盤とした膜機能分子の生理機能理解に向けて」（オンライン開催）, 2022年09月05日
  10. Two-Pore Channel 3 における 2番目のS4ヘリックスの構造変化の解析, 下村 拓史, 第11回 名古屋大学医学系研究科・生理学研究所合同シンポジウム, 2021年09月25日
  11. Two-Pore Na+ Channel 3 における 特徴的な電位依存的活性化メカニズム, 下村 拓史, 生理研研究会「イオンチャネルと生体膜のダイナミズム：構造生物学の先にあるもの」, 2019年10月01日
  12. Tutorial for physiologists: Practical Approaches to Protein Structural Information, Yuichiro Fujiwara; Takushi Shimomura; Katsumasa irie, 9th Federation of the Asian and Oceanian Physiological societies Congress, 2019年03月31日
  13. Phosphoinositides modulate the voltage dependence in Two-Pore Na+ Channel 3 (TPC3), Takushi Shimomura, The 49th NIPS International Symposium "Ion channels: looking back, seeing ahead", 2018年12月08日
  14. Two-Pore Na+ Channel 3にみられる長期脱分極刺激依存的な活性亢進の分子メカニズムについての解析, 下村 拓史, 第65回中部日本生理学会, 2018年11月17日
  15. Phosphoinositides modulate the voltage dependence in Two-Pore Na+ Channel 3 (TPC3), Takushi Shimomura, Joint academic activities of McGill University and National Institute of Physiological Sciences, 2018年10月22日
  16. Two pore Na+ channel 3 (TPC3) の 電位依存的活性化メカニズム, 下村 拓史, 生理学研究所プロジェクト「細胞・システム作動機構の理解に向けた、生体タンパク質分子の構造と機能のダイナミクス研究の拠点形成」平成28年度末シンポジウム, 2017年03月13日
  17. 薬理解析により明らかになった、原核生物由来の膜電位感受性Naチャネルにおける内腔の構造変化, 下村 拓史, 第51回日本生物物理学会年会, 2013年09月
  18. 四級アンモニウム化合物による四量体型 Na チャネルの阻害メカニズムの解析, 下村 拓史, 生理学研究所研究会「膜機能分子の機能・構造ゆらぎの時空間スペクトル解析」, 2012年09月06日
  19. 膜電位感受性Na+チャネルの電位感受性変異体に見られるセンサードメインの位置変化, 下村 拓史, 第82回日本生化学会大会, 2009年
  20. PIP2-dependent modulation of voltage dependence in Two-Pore Na+ Channel 3, 下村 拓史, 第8回 生理研―霊長研―脳研合同シンポジウム

受賞

  1. 2024年07月, 第13回 自然科学研究機構 若手研究者賞, 自然科学研究機構
  2. 2019年, 第10回入澤宏・彩記念若手研究奨励賞日本生理学会奨励賞, 日本生理学会
  3. 2009年, 第82回日本生化学会大会 優秀プレゼンテーション賞, 日本生化学会

外部資金

競争的資金等の採択状況

  1. 研究費助成, リソソームを標的とした革新的光遺伝学ツール創出法, 2025年01月, 2027年01月
  2. 科学研究費助成事業, 光生理学的手法を用いたTwo pore channelにおけるイオン選択性制御の分子基盤の解明, 2023年04月01日, 2026年03月31日
    関連URL
  3. 研究助成金, 遺伝暗号拡張法を利用した光遺伝学ツール作成法の創出, 2025年02月
  4. 科学研究費助成事業, 非天然アミノ酸を用いた汎用かつ簡便なタンパク質光感受化法, 2022年04月01日, 2024年03月31日
    関連URL
  5. 研究助成, 非天然アミノ酸を利用した光遺伝学ツール作成法, 2021年10月, 2024年03月
  6. 科学研究費助成事業, 非天然アミノ酸を利用した、イオンチャネルの特定状態を指向した解析, 2020年04月01日, 2023年03月31日
    関連URL
  7. 科学研究費助成事業, 光異性化アミノ酸導入による、リガンド依存性イオンチャネルの光制御化法の開発, 2020年04月01日, 2022年03月31日
    関連URL
  8. 医学系研究助成（基礎）, 非天然アミノ酸を利用した光遺伝学ツール作成法, 2022年
  9. 科学研究費助成事業, 受精時の多精拒否におけるTPC3チャネルの役割の解明, 2018年04月01日, 2020年03月31日
    関連URL
  10. 科学研究費助成事業, 定説を覆す電位依存的制御メカニズムを有するNa+チャネルの光生理学的解析, 2016年04月01日, 2018年03月31日
    関連URL

社会活動

その他社会貢献活動（広大・部局主催含）

  1. 「未来の科学者賞」選考委員, 岡崎市教育委員会, 2021年/10月/08日